Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NlkO54949 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NlkO54949 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NlkO54949 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NlkO54949 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NlkO54949 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NlkO54949 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NlkO54949 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NlkO54949 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NlkO54949 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NlkO54949 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NlkO54949 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NlkO54949 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NlkO54949 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NlkO54949 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NlkO54949 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NlkO54949 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NlkO54949 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NlkO54949 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NlkO54949 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NlkO54949 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NlkO54949 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NlkO54949 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NlkO54949 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NlkO54949 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NlkO54949 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NlkO54949 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NlkO54949 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NlkO54949 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NlkO54949 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NlkO54949 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NlkO54949 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NlkO54949 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NlkO54949 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NlkO54949 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NlkO54949 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NlkO54949 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NlkO54949 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NlkO54949 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NlkO54949 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NlkO54949 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NlkO54949 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NlkO54949 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NlkO54949 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NlkO54949 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NlkO54949 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NlkO54949 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NlkO54949 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NlkO54949 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NlkO54949 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NlkO54949 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NlkO54949 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NlkO54949 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NlkO54949 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NlkO54949 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NlkO54949 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NlkO54949 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NlkO54949 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NlkO54949 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NlkO54949 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NlkO54949 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NlkO54949 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NlkO54949 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NlkO54949 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NlkO54949 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NlkO54949 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NlkO54949 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NlkO54949 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NlkO54949 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NlkO54949 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NlkO54949 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NlkO54949 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NlkO54949 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NlkO54949 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NlkO54949 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NlkO54949 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NlkO54949 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NlkO54949 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NlkO54949 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NlkO54949 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NlkO54949 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NlkO54949 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NlkO54949 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NlkO54949 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NlkO54949 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NlkO54949 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NlkO54949 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NlkO54949 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NlkO54949 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NlkO54949 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NlkO54949 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NlkO54949 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NlkO54949 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NlkO54949 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NlkO54949 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NlkO54949 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NlkO54949 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NlkO54949 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NlkO54949 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NlkO54949 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms