Protein–RNA interactions for Protein: O54915

Nr1i2, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 2, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1i2O54915 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nr1i2O54915 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nr1i2O54915 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nr1i2O54915 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nr1i2O54915 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nr1i2O54915 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nr1i2O54915 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nr1i2O54915 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nr1i2O54915 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Nr1i2O54915 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nr1i2O54915 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nr1i2O54915 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nr1i2O54915 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nr1i2O54915 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nr1i2O54915 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nr1i2O54915 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nr1i2O54915 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nr1i2O54915 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nr1i2O54915 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nr1i2O54915 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nr1i2O54915 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Nr1i2O54915 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nr1i2O54915 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nr1i2O54915 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nr1i2O54915 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nr1i2O54915 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nr1i2O54915 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nr1i2O54915 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nr1i2O54915 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nr1i2O54915 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nr1i2O54915 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nr1i2O54915 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nr1i2O54915 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nr1i2O54915 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nr1i2O54915 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nr1i2O54915 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nr1i2O54915 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nr1i2O54915 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nr1i2O54915 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nr1i2O54915 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nr1i2O54915 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nr1i2O54915 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nr1i2O54915 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nr1i2O54915 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nr1i2O54915 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nr1i2O54915 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nr1i2O54915 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nr1i2O54915 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nr1i2O54915 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nr1i2O54915 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Nr1i2O54915 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nr1i2O54915 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nr1i2O54915 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nr1i2O54915 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nr1i2O54915 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nr1i2O54915 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nr1i2O54915 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nr1i2O54915 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nr1i2O54915 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nr1i2O54915 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nr1i2O54915 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nr1i2O54915 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nr1i2O54915 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nr1i2O54915 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Nr1i2O54915 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nr1i2O54915 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nr1i2O54915 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nr1i2O54915 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nr1i2O54915 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nr1i2O54915 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nr1i2O54915 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nr1i2O54915 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nr1i2O54915 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nr1i2O54915 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nr1i2O54915 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nr1i2O54915 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nr1i2O54915 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nr1i2O54915 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nr1i2O54915 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nr1i2O54915 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nr1i2O54915 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nr1i2O54915 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nr1i2O54915 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nr1i2O54915 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nr1i2O54915 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nr1i2O54915 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nr1i2O54915 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nr1i2O54915 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nr1i2O54915 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nr1i2O54915 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nr1i2O54915 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nr1i2O54915 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nr1i2O54915 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nr1i2O54915 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nr1i2O54915 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nr1i2O54915 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nr1i2O54915 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nr1i2O54915 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nr1i2O54915 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nr1i2O54915 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1167.4 ms