Protein–RNA interactions for Protein: O54907

Tnfsf12, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 12, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf12O54907 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf12O54907 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf12O54907 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf12O54907 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf12O54907 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tnfsf12O54907 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf12O54907 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf12O54907 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf12O54907 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf12O54907 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf12O54907 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf12O54907 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf12O54907 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf12O54907 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf12O54907 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf12O54907 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf12O54907 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf12O54907 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf12O54907 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf12O54907 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf12O54907 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf12O54907 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf12O54907 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf12O54907 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf12O54907 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf12O54907 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf12O54907 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf12O54907 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf12O54907 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf12O54907 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf12O54907 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf12O54907 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf12O54907 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf12O54907 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf12O54907 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf12O54907 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf12O54907 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf12O54907 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf12O54907 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf12O54907 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf12O54907 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf12O54907 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf12O54907 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf12O54907 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf12O54907 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf12O54907 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf12O54907 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf12O54907 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf12O54907 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf12O54907 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf12O54907 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf12O54907 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf12O54907 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf12O54907 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf12O54907 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf12O54907 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf12O54907 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf12O54907 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf12O54907 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf12O54907 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf12O54907 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf12O54907 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf12O54907 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf12O54907 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf12O54907 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf12O54907 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf12O54907 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf12O54907 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf12O54907 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf12O54907 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf12O54907 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf12O54907 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf12O54907 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf12O54907 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf12O54907 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnfsf12O54907 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnfsf12O54907 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnfsf12O54907 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf12O54907 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf12O54907 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf12O54907 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf12O54907 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf12O54907 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf12O54907 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf12O54907 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf12O54907 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf12O54907 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf12O54907 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf12O54907 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf12O54907 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf12O54907 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf12O54907 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf12O54907 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf12O54907 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf12O54907 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf12O54907 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf12O54907 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf12O54907 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf12O54907 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf12O54907 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms