Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CrxO54751 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
CrxO54751 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
CrxO54751 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CrxO54751 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CrxO54751 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CrxO54751 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CrxO54751 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CrxO54751 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CrxO54751 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CrxO54751 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CrxO54751 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CrxO54751 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CrxO54751 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CrxO54751 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CrxO54751 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CrxO54751 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CrxO54751 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CrxO54751 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CrxO54751 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CrxO54751 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CrxO54751 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CrxO54751 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CrxO54751 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CrxO54751 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CrxO54751 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CrxO54751 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CrxO54751 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CrxO54751 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CrxO54751 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CrxO54751 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CrxO54751 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CrxO54751 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CrxO54751 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CrxO54751 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CrxO54751 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CrxO54751 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CrxO54751 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CrxO54751 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CrxO54751 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CrxO54751 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CrxO54751 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CrxO54751 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CrxO54751 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CrxO54751 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CrxO54751 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CrxO54751 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CrxO54751 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CrxO54751 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CrxO54751 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CrxO54751 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CrxO54751 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CrxO54751 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CrxO54751 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CrxO54751 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CrxO54751 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CrxO54751 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CrxO54751 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CrxO54751 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CrxO54751 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CrxO54751 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CrxO54751 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CrxO54751 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CrxO54751 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CrxO54751 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CrxO54751 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CrxO54751 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CrxO54751 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CrxO54751 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CrxO54751 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CrxO54751 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CrxO54751 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CrxO54751 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CrxO54751 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CrxO54751 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CrxO54751 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CrxO54751 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CrxO54751 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CrxO54751 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CrxO54751 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CrxO54751 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CrxO54751 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CrxO54751 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CrxO54751 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CrxO54751 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CrxO54751 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CrxO54751 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CrxO54751 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CrxO54751 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CrxO54751 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CrxO54751 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CrxO54751 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CrxO54751 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CrxO54751 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CrxO54751 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CrxO54751 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CrxO54751 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CrxO54751 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CrxO54751 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CrxO54751 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.2 ms