Protein–RNA interactions for Protein: O54689

Ccr6, C-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr6O54689 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccr6O54689 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccr6O54689 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccr6O54689 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccr6O54689 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccr6O54689 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccr6O54689 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccr6O54689 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccr6O54689 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccr6O54689 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccr6O54689 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccr6O54689 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccr6O54689 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccr6O54689 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccr6O54689 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccr6O54689 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccr6O54689 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccr6O54689 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccr6O54689 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccr6O54689 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccr6O54689 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccr6O54689 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccr6O54689 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccr6O54689 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccr6O54689 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccr6O54689 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccr6O54689 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccr6O54689 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccr6O54689 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccr6O54689 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccr6O54689 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccr6O54689 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccr6O54689 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccr6O54689 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccr6O54689 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccr6O54689 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccr6O54689 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccr6O54689 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccr6O54689 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccr6O54689 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccr6O54689 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccr6O54689 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccr6O54689 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccr6O54689 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccr6O54689 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccr6O54689 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccr6O54689 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccr6O54689 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccr6O54689 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccr6O54689 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccr6O54689 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccr6O54689 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccr6O54689 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccr6O54689 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccr6O54689 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccr6O54689 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccr6O54689 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccr6O54689 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccr6O54689 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccr6O54689 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccr6O54689 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccr6O54689 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccr6O54689 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccr6O54689 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccr6O54689 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccr6O54689 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccr6O54689 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccr6O54689 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccr6O54689 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccr6O54689 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccr6O54689 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccr6O54689 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccr6O54689 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccr6O54689 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccr6O54689 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccr6O54689 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccr6O54689 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccr6O54689 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccr6O54689 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccr6O54689 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccr6O54689 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccr6O54689 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccr6O54689 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccr6O54689 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccr6O54689 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccr6O54689 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccr6O54689 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccr6O54689 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccr6O54689 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccr6O54689 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccr6O54689 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccr6O54689 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccr6O54689 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccr6O54689 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccr6O54689 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccr6O54689 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccr6O54689 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccr6O54689 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccr6O54689 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccr6O54689 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms