Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nek2O35942 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nek2O35942 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nek2O35942 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nek2O35942 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Nek2O35942 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nek2O35942 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nek2O35942 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nek2O35942 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nek2O35942 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nek2O35942 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nek2O35942 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nek2O35942 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nek2O35942 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nek2O35942 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nek2O35942 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nek2O35942 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nek2O35942 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nek2O35942 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nek2O35942 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nek2O35942 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nek2O35942 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nek2O35942 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nek2O35942 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nek2O35942 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nek2O35942 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nek2O35942 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Nek2O35942 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nek2O35942 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nek2O35942 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nek2O35942 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nek2O35942 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nek2O35942 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nek2O35942 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nek2O35942 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nek2O35942 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nek2O35942 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nek2O35942 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nek2O35942 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nek2O35942 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nek2O35942 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nek2O35942 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Nek2O35942 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nek2O35942 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nek2O35942 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nek2O35942 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nek2O35942 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nek2O35942 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nek2O35942 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nek2O35942 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nek2O35942 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nek2O35942 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nek2O35942 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nek2O35942 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nek2O35942 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nek2O35942 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nek2O35942 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nek2O35942 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nek2O35942 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nek2O35942 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nek2O35942 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nek2O35942 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nek2O35942 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nek2O35942 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Nek2O35942 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Nek2O35942 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Nek2O35942 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Nek2O35942 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nek2O35942 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nek2O35942 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nek2O35942 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nek2O35942 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Nek2O35942 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nek2O35942 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nek2O35942 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nek2O35942 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nek2O35942 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nek2O35942 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nek2O35942 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nek2O35942 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nek2O35942 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nek2O35942 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nek2O35942 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nek2O35942 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nek2O35942 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nek2O35942 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Nek2O35942 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nek2O35942 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nek2O35942 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nek2O35942 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nek2O35942 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nek2O35942 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nek2O35942 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nek2O35942 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nek2O35942 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nek2O35942 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nek2O35942 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nek2O35942 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nek2O35942 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nek2O35942 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms