Protein–RNA interactions for Protein: O35885

Ascl2, Achaete-scute homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl2O35885 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ascl2O35885 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ascl2O35885 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ascl2O35885 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ascl2O35885 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ascl2O35885 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ascl2O35885 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ascl2O35885 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ascl2O35885 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ascl2O35885 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ascl2O35885 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ascl2O35885 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ascl2O35885 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ascl2O35885 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ascl2O35885 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ascl2O35885 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ascl2O35885 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ascl2O35885 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ascl2O35885 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ascl2O35885 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ascl2O35885 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ascl2O35885 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ascl2O35885 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ascl2O35885 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ascl2O35885 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ascl2O35885 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ascl2O35885 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ascl2O35885 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ascl2O35885 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ascl2O35885 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ascl2O35885 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ascl2O35885 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ascl2O35885 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ascl2O35885 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ascl2O35885 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ascl2O35885 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ascl2O35885 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ascl2O35885 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ascl2O35885 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ascl2O35885 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ascl2O35885 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ascl2O35885 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ascl2O35885 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ascl2O35885 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ascl2O35885 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ascl2O35885 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ascl2O35885 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ascl2O35885 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ascl2O35885 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ascl2O35885 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ascl2O35885 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ascl2O35885 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ascl2O35885 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ascl2O35885 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ascl2O35885 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ascl2O35885 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ascl2O35885 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ascl2O35885 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ascl2O35885 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ascl2O35885 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ascl2O35885 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ascl2O35885 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ascl2O35885 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ascl2O35885 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ascl2O35885 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ascl2O35885 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ascl2O35885 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ascl2O35885 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ascl2O35885 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ascl2O35885 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ascl2O35885 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ascl2O35885 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ascl2O35885 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ascl2O35885 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ascl2O35885 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ascl2O35885 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ascl2O35885 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ascl2O35885 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ascl2O35885 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ascl2O35885 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ascl2O35885 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ascl2O35885 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ascl2O35885 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ascl2O35885 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ascl2O35885 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ascl2O35885 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ascl2O35885 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ascl2O35885 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ascl2O35885 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ascl2O35885 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ascl2O35885 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ascl2O35885 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ascl2O35885 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ascl2O35885 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ascl2O35885 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ascl2O35885 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ascl2O35885 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ascl2O35885 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ascl2O35885 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ascl2O35885 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms