Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NudcO35685 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NudcO35685 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NudcO35685 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NudcO35685 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NudcO35685 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NudcO35685 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NudcO35685 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NudcO35685 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NudcO35685 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NudcO35685 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NudcO35685 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NudcO35685 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NudcO35685 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NudcO35685 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NudcO35685 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NudcO35685 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NudcO35685 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NudcO35685 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NudcO35685 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NudcO35685 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NudcO35685 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NudcO35685 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NudcO35685 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NudcO35685 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NudcO35685 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NudcO35685 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NudcO35685 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NudcO35685 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NudcO35685 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NudcO35685 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NudcO35685 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NudcO35685 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NudcO35685 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NudcO35685 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NudcO35685 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NudcO35685 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NudcO35685 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NudcO35685 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NudcO35685 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NudcO35685 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NudcO35685 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NudcO35685 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NudcO35685 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NudcO35685 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NudcO35685 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NudcO35685 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NudcO35685 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NudcO35685 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NudcO35685 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NudcO35685 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NudcO35685 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NudcO35685 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NudcO35685 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NudcO35685 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NudcO35685 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NudcO35685 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NudcO35685 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NudcO35685 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NudcO35685 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NudcO35685 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
NudcO35685 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NudcO35685 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NudcO35685 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NudcO35685 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NudcO35685 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NudcO35685 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NudcO35685 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NudcO35685 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NudcO35685 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NudcO35685 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NudcO35685 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NudcO35685 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NudcO35685 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NudcO35685 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NudcO35685 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NudcO35685 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NudcO35685 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NudcO35685 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NudcO35685 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NudcO35685 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NudcO35685 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NudcO35685 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NudcO35685 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NudcO35685 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NudcO35685 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NudcO35685 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NudcO35685 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NudcO35685 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NudcO35685 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NudcO35685 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NudcO35685 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NudcO35685 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NudcO35685 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NudcO35685 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NudcO35685 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NudcO35685 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NudcO35685 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NudcO35685 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NudcO35685 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms