Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stag2O35638 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stag2O35638 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stag2O35638 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stag2O35638 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stag2O35638 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stag2O35638 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stag2O35638 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Stag2O35638 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Stag2O35638 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stag2O35638 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stag2O35638 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Stag2O35638 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stag2O35638 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stag2O35638 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stag2O35638 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stag2O35638 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stag2O35638 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stag2O35638 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stag2O35638 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stag2O35638 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Stag2O35638 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Stag2O35638 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stag2O35638 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stag2O35638 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stag2O35638 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stag2O35638 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stag2O35638 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stag2O35638 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stag2O35638 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stag2O35638 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Stag2O35638 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Stag2O35638 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Stag2O35638 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stag2O35638 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stag2O35638 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stag2O35638 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stag2O35638 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stag2O35638 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stag2O35638 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stag2O35638 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stag2O35638 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stag2O35638 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stag2O35638 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stag2O35638 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stag2O35638 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stag2O35638 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Stag2O35638 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stag2O35638 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stag2O35638 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stag2O35638 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stag2O35638 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stag2O35638 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stag2O35638 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stag2O35638 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stag2O35638 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stag2O35638 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stag2O35638 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stag2O35638 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stag2O35638 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stag2O35638 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stag2O35638 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stag2O35638 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stag2O35638 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Stag2O35638 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stag2O35638 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stag2O35638 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stag2O35638 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stag2O35638 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stag2O35638 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stag2O35638 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stag2O35638 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stag2O35638 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stag2O35638 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stag2O35638 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stag2O35638 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Stag2O35638 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Stag2O35638 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Stag2O35638 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Stag2O35638 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Stag2O35638 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Stag2O35638 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Stag2O35638 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Stag2O35638 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Stag2O35638 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Stag2O35638 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Stag2O35638 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Stag2O35638 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Stag2O35638 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stag2O35638 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stag2O35638 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stag2O35638 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stag2O35638 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stag2O35638 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Stag2O35638 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stag2O35638 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stag2O35638 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stag2O35638 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stag2O35638 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stag2O35638 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms