Protein–RNA interactions for Protein: O35526

Stx1a, Syntaxin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1aO35526 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stx1aO35526 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stx1aO35526 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stx1aO35526 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stx1aO35526 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stx1aO35526 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stx1aO35526 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stx1aO35526 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stx1aO35526 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stx1aO35526 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Stx1aO35526 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stx1aO35526 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stx1aO35526 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stx1aO35526 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stx1aO35526 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stx1aO35526 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Stx1aO35526 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stx1aO35526 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stx1aO35526 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stx1aO35526 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stx1aO35526 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stx1aO35526 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stx1aO35526 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stx1aO35526 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stx1aO35526 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stx1aO35526 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stx1aO35526 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stx1aO35526 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stx1aO35526 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Stx1aO35526 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stx1aO35526 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stx1aO35526 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stx1aO35526 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stx1aO35526 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stx1aO35526 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stx1aO35526 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stx1aO35526 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stx1aO35526 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stx1aO35526 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stx1aO35526 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stx1aO35526 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stx1aO35526 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stx1aO35526 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stx1aO35526 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stx1aO35526 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stx1aO35526 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stx1aO35526 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stx1aO35526 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stx1aO35526 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stx1aO35526 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stx1aO35526 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stx1aO35526 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stx1aO35526 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stx1aO35526 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stx1aO35526 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stx1aO35526 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stx1aO35526 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stx1aO35526 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stx1aO35526 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stx1aO35526 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stx1aO35526 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stx1aO35526 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stx1aO35526 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stx1aO35526 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stx1aO35526 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stx1aO35526 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stx1aO35526 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Stx1aO35526 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stx1aO35526 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stx1aO35526 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stx1aO35526 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stx1aO35526 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stx1aO35526 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stx1aO35526 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stx1aO35526 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stx1aO35526 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stx1aO35526 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stx1aO35526 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stx1aO35526 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stx1aO35526 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stx1aO35526 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stx1aO35526 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stx1aO35526 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stx1aO35526 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stx1aO35526 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stx1aO35526 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stx1aO35526 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stx1aO35526 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stx1aO35526 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stx1aO35526 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stx1aO35526 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stx1aO35526 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stx1aO35526 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stx1aO35526 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stx1aO35526 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stx1aO35526 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stx1aO35526 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stx1aO35526 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stx1aO35526 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stx1aO35526 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms