Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clk2O35491 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clk2O35491 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clk2O35491 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clk2O35491 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clk2O35491 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clk2O35491 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clk2O35491 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clk2O35491 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clk2O35491 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clk2O35491 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Clk2O35491 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clk2O35491 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clk2O35491 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clk2O35491 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clk2O35491 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clk2O35491 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Clk2O35491 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clk2O35491 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clk2O35491 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clk2O35491 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Clk2O35491 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Clk2O35491 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clk2O35491 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clk2O35491 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clk2O35491 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clk2O35491 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clk2O35491 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clk2O35491 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clk2O35491 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clk2O35491 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clk2O35491 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clk2O35491 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clk2O35491 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clk2O35491 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clk2O35491 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clk2O35491 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clk2O35491 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clk2O35491 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clk2O35491 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clk2O35491 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clk2O35491 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clk2O35491 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clk2O35491 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clk2O35491 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Clk2O35491 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Clk2O35491 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clk2O35491 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clk2O35491 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clk2O35491 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clk2O35491 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clk2O35491 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clk2O35491 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clk2O35491 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clk2O35491 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clk2O35491 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clk2O35491 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clk2O35491 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clk2O35491 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clk2O35491 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clk2O35491 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clk2O35491 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clk2O35491 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Clk2O35491 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clk2O35491 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clk2O35491 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clk2O35491 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clk2O35491 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clk2O35491 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clk2O35491 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clk2O35491 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clk2O35491 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clk2O35491 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clk2O35491 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clk2O35491 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clk2O35491 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clk2O35491 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clk2O35491 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Clk2O35491 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Clk2O35491 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Clk2O35491 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clk2O35491 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clk2O35491 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clk2O35491 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clk2O35491 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clk2O35491 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clk2O35491 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clk2O35491 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clk2O35491 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clk2O35491 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clk2O35491 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clk2O35491 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clk2O35491 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clk2O35491 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clk2O35491 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clk2O35491 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clk2O35491 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clk2O35491 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clk2O35491 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clk2O35491 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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