Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sema6aO35464 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sema6aO35464 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sema6aO35464 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sema6aO35464 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sema6aO35464 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sema6aO35464 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sema6aO35464 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sema6aO35464 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sema6aO35464 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sema6aO35464 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sema6aO35464 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sema6aO35464 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sema6aO35464 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sema6aO35464 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sema6aO35464 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sema6aO35464 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sema6aO35464 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sema6aO35464 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Sema6aO35464 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sema6aO35464 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sema6aO35464 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sema6aO35464 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sema6aO35464 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sema6aO35464 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Sema6aO35464 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sema6aO35464 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sema6aO35464 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sema6aO35464 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Sema6aO35464 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sema6aO35464 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sema6aO35464 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sema6aO35464 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sema6aO35464 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sema6aO35464 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sema6aO35464 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sema6aO35464 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sema6aO35464 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sema6aO35464 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sema6aO35464 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sema6aO35464 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sema6aO35464 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sema6aO35464 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sema6aO35464 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sema6aO35464 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sema6aO35464 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sema6aO35464 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sema6aO35464 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sema6aO35464 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sema6aO35464 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sema6aO35464 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sema6aO35464 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sema6aO35464 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sema6aO35464 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sema6aO35464 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Sema6aO35464 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Sema6aO35464 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sema6aO35464 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sema6aO35464 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sema6aO35464 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sema6aO35464 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sema6aO35464 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sema6aO35464 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sema6aO35464 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sema6aO35464 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Sema6aO35464 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sema6aO35464 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sema6aO35464 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sema6aO35464 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sema6aO35464 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sema6aO35464 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sema6aO35464 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sema6aO35464 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sema6aO35464 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sema6aO35464 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sema6aO35464 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sema6aO35464 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sema6aO35464 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sema6aO35464 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sema6aO35464 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sema6aO35464 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sema6aO35464 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sema6aO35464 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sema6aO35464 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sema6aO35464 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sema6aO35464 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sema6aO35464 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sema6aO35464 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sema6aO35464 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sema6aO35464 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sema6aO35464 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sema6aO35464 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sema6aO35464 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sema6aO35464 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sema6aO35464 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sema6aO35464 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sema6aO35464 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sema6aO35464 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sema6aO35464 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sema6aO35464 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms