Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prrt1O35449 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prrt1O35449 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prrt1O35449 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prrt1O35449 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prrt1O35449 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Prrt1O35449 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prrt1O35449 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Prrt1O35449 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Prrt1O35449 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Prrt1O35449 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prrt1O35449 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prrt1O35449 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prrt1O35449 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prrt1O35449 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prrt1O35449 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prrt1O35449 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prrt1O35449 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prrt1O35449 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prrt1O35449 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prrt1O35449 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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