Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pkd2O35245 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pkd2O35245 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pkd2O35245 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pkd2O35245 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pkd2O35245 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pkd2O35245 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pkd2O35245 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pkd2O35245 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Pkd2O35245 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pkd2O35245 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pkd2O35245 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pkd2O35245 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pkd2O35245 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pkd2O35245 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pkd2O35245 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pkd2O35245 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pkd2O35245 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Pkd2O35245 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pkd2O35245 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pkd2O35245 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pkd2O35245 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pkd2O35245 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pkd2O35245 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pkd2O35245 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pkd2O35245 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pkd2O35245 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pkd2O35245 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pkd2O35245 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pkd2O35245 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pkd2O35245 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pkd2O35245 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pkd2O35245 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Pkd2O35245 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pkd2O35245 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pkd2O35245 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pkd2O35245 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pkd2O35245 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pkd2O35245 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pkd2O35245 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Pkd2O35245 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pkd2O35245 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Pkd2O35245 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pkd2O35245 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pkd2O35245 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pkd2O35245 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Pkd2O35245 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pkd2O35245 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pkd2O35245 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pkd2O35245 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pkd2O35245 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pkd2O35245 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pkd2O35245 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pkd2O35245 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pkd2O35245 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pkd2O35245 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pkd2O35245 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Pkd2O35245 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pkd2O35245 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pkd2O35245 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pkd2O35245 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pkd2O35245 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pkd2O35245 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pkd2O35245 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pkd2O35245 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pkd2O35245 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pkd2O35245 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Pkd2O35245 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Pkd2O35245 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Pkd2O35245 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Pkd2O35245 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Pkd2O35245 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Pkd2O35245 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Pkd2O35245 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Pkd2O35245 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Pkd2O35245 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pkd2O35245 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pkd2O35245 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pkd2O35245 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pkd2O35245 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pkd2O35245 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pkd2O35245 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Pkd2O35245 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pkd2O35245 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pkd2O35245 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pkd2O35245 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pkd2O35245 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pkd2O35245 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pkd2O35245 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pkd2O35245 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pkd2O35245 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pkd2O35245 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pkd2O35245 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pkd2O35245 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pkd2O35245 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pkd2O35245 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pkd2O35245 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pkd2O35245 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pkd2O35245 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pkd2O35245 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms