Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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Ptpn9O35239 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ptpn9O35239 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ptpn9O35239 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ptpn9O35239 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ptpn9O35239 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ptpn9O35239 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ptpn9O35239 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ptpn9O35239 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Ptpn9O35239 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Ptpn9O35239 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ptpn9O35239 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Ptpn9O35239 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ptpn9O35239 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ptpn9O35239 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ptpn9O35239 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ptpn9O35239 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ptpn9O35239 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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Ptpn9O35239 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ptpn9O35239 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ptpn9O35239 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
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Ptpn9O35239 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ptpn9O35239 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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Ptpn9O35239 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ptpn9O35239 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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Ptpn9O35239 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ptpn9O35239 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ptpn9O35239 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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Ptpn9O35239 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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Ptpn9O35239 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ptpn9O35239 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
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Ptpn9O35239 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ptpn9O35239 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
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Ptpn9O35239 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
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