Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Polr1aO35134 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Polr1aO35134 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Polr1aO35134 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Polr1aO35134 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Polr1aO35134 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Polr1aO35134 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Polr1aO35134 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Polr1aO35134 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Polr1aO35134 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Polr1aO35134 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Polr1aO35134 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Polr1aO35134 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Polr1aO35134 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Polr1aO35134 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Polr1aO35134 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Polr1aO35134 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Polr1aO35134 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Polr1aO35134 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Polr1aO35134 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Polr1aO35134 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Polr1aO35134 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Polr1aO35134 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Polr1aO35134 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
Polr1aO35134 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Polr1aO35134 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Polr1aO35134 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Polr1aO35134 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Polr1aO35134 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Polr1aO35134 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Polr1aO35134 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Polr1aO35134 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Polr1aO35134 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Polr1aO35134 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Polr1aO35134 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Polr1aO35134 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
Polr1aO35134 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
Polr1aO35134 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Polr1aO35134 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Polr1aO35134 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Polr1aO35134 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Polr1aO35134 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Polr1aO35134 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Polr1aO35134 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Polr1aO35134 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Polr1aO35134 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Polr1aO35134 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Polr1aO35134 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Polr1aO35134 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Polr1aO35134 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Polr1aO35134 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Polr1aO35134 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Polr1aO35134 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Polr1aO35134 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Polr1aO35134 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Polr1aO35134 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
Polr1aO35134 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Polr1aO35134 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Polr1aO35134 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Polr1aO35134 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Polr1aO35134 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Polr1aO35134 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Polr1aO35134 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Polr1aO35134 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Polr1aO35134 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Polr1aO35134 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
Polr1aO35134 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Polr1aO35134 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Polr1aO35134 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Polr1aO35134 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Polr1aO35134 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Polr1aO35134 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Polr1aO35134 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Polr1aO35134 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Polr1aO35134 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Polr1aO35134 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Polr1aO35134 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Polr1aO35134 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Polr1aO35134 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Polr1aO35134 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Polr1aO35134 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
Polr1aO35134 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Polr1aO35134 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Polr1aO35134 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Polr1aO35134 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Polr1aO35134 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Polr1aO35134 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Polr1aO35134 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Polr1aO35134 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Polr1aO35134 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Polr1aO35134 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Polr1aO35134 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Polr1aO35134 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Polr1aO35134 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Polr1aO35134 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Polr1aO35134 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Polr1aO35134 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Polr1aO35134 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Polr1aO35134 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Polr1aO35134 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms