Protein–RNA interactions for Protein: O09172

Gclm, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GclmO09172 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GclmO09172 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GclmO09172 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GclmO09172 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GclmO09172 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GclmO09172 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GclmO09172 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GclmO09172 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GclmO09172 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GclmO09172 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GclmO09172 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GclmO09172 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GclmO09172 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GclmO09172 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GclmO09172 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GclmO09172 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GclmO09172 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GclmO09172 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GclmO09172 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GclmO09172 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GclmO09172 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GclmO09172 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GclmO09172 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GclmO09172 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GclmO09172 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GclmO09172 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GclmO09172 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GclmO09172 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GclmO09172 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GclmO09172 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GclmO09172 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GclmO09172 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GclmO09172 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GclmO09172 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GclmO09172 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GclmO09172 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GclmO09172 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GclmO09172 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GclmO09172 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GclmO09172 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GclmO09172 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GclmO09172 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GclmO09172 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GclmO09172 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GclmO09172 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GclmO09172 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GclmO09172 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GclmO09172 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GclmO09172 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GclmO09172 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GclmO09172 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GclmO09172 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GclmO09172 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GclmO09172 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GclmO09172 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GclmO09172 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GclmO09172 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GclmO09172 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GclmO09172 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GclmO09172 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GclmO09172 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GclmO09172 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GclmO09172 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GclmO09172 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GclmO09172 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GclmO09172 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GclmO09172 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GclmO09172 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GclmO09172 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GclmO09172 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GclmO09172 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GclmO09172 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GclmO09172 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GclmO09172 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GclmO09172 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GclmO09172 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GclmO09172 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GclmO09172 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GclmO09172 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GclmO09172 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GclmO09172 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GclmO09172 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GclmO09172 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GclmO09172 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GclmO09172 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GclmO09172 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GclmO09172 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GclmO09172 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GclmO09172 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GclmO09172 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GclmO09172 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GclmO09172 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GclmO09172 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GclmO09172 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GclmO09172 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GclmO09172 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GclmO09172 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GclmO09172 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GclmO09172 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GclmO09172 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms