Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MttpO08601 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MttpO08601 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MttpO08601 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MttpO08601 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MttpO08601 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MttpO08601 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MttpO08601 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MttpO08601 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MttpO08601 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MttpO08601 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MttpO08601 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MttpO08601 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MttpO08601 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MttpO08601 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MttpO08601 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MttpO08601 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MttpO08601 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MttpO08601 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MttpO08601 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MttpO08601 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MttpO08601 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MttpO08601 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MttpO08601 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MttpO08601 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MttpO08601 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MttpO08601 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MttpO08601 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MttpO08601 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MttpO08601 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MttpO08601 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MttpO08601 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MttpO08601 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MttpO08601 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MttpO08601 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MttpO08601 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MttpO08601 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MttpO08601 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MttpO08601 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MttpO08601 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MttpO08601 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MttpO08601 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MttpO08601 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MttpO08601 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MttpO08601 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MttpO08601 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MttpO08601 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MttpO08601 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
MttpO08601 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MttpO08601 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MttpO08601 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MttpO08601 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MttpO08601 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MttpO08601 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MttpO08601 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
MttpO08601 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MttpO08601 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
MttpO08601 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MttpO08601 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MttpO08601 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MttpO08601 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MttpO08601 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MttpO08601 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MttpO08601 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MttpO08601 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MttpO08601 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MttpO08601 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MttpO08601 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MttpO08601 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MttpO08601 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MttpO08601 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MttpO08601 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
MttpO08601 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
MttpO08601 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MttpO08601 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MttpO08601 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MttpO08601 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MttpO08601 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MttpO08601 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MttpO08601 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MttpO08601 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MttpO08601 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MttpO08601 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MttpO08601 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MttpO08601 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MttpO08601 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
MttpO08601 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MttpO08601 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MttpO08601 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MttpO08601 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MttpO08601 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MttpO08601 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MttpO08601 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MttpO08601 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MttpO08601 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MttpO08601 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MttpO08601 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MttpO08601 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MttpO08601 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MttpO08601 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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