Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sec22bO08547 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sec22bO08547 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sec22bO08547 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sec22bO08547 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sec22bO08547 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sec22bO08547 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sec22bO08547 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sec22bO08547 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sec22bO08547 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sec22bO08547 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sec22bO08547 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sec22bO08547 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sec22bO08547 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sec22bO08547 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Sec22bO08547 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sec22bO08547 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sec22bO08547 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sec22bO08547 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sec22bO08547 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sec22bO08547 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sec22bO08547 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sec22bO08547 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sec22bO08547 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sec22bO08547 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sec22bO08547 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sec22bO08547 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Sec22bO08547 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sec22bO08547 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sec22bO08547 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sec22bO08547 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sec22bO08547 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sec22bO08547 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sec22bO08547 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sec22bO08547 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sec22bO08547 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sec22bO08547 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sec22bO08547 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sec22bO08547 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sec22bO08547 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sec22bO08547 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sec22bO08547 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Sec22bO08547 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sec22bO08547 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sec22bO08547 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sec22bO08547 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sec22bO08547 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sec22bO08547 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sec22bO08547 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sec22bO08547 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sec22bO08547 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sec22bO08547 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sec22bO08547 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sec22bO08547 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sec22bO08547 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sec22bO08547 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sec22bO08547 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sec22bO08547 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sec22bO08547 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sec22bO08547 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sec22bO08547 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sec22bO08547 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sec22bO08547 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sec22bO08547 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sec22bO08547 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sec22bO08547 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sec22bO08547 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sec22bO08547 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sec22bO08547 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sec22bO08547 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sec22bO08547 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sec22bO08547 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sec22bO08547 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sec22bO08547 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sec22bO08547 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sec22bO08547 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sec22bO08547 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Sec22bO08547 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sec22bO08547 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sec22bO08547 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sec22bO08547 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sec22bO08547 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sec22bO08547 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sec22bO08547 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sec22bO08547 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sec22bO08547 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sec22bO08547 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sec22bO08547 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Sec22bO08547 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sec22bO08547 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sec22bO08547 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sec22bO08547 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sec22bO08547 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Sec22bO08547 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sec22bO08547 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sec22bO08547 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sec22bO08547 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Sec22bO08547 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Sec22bO08547 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sec22bO08547 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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