Protein–RNA interactions for Protein: M0QW46

Ascl4, Achaete-scute family bHLH transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl4M0QW46 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ascl4M0QW46 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ascl4M0QW46 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ascl4M0QW46 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ascl4M0QW46 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ascl4M0QW46 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ascl4M0QW46 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ascl4M0QW46 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ascl4M0QW46 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ascl4M0QW46 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ascl4M0QW46 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ascl4M0QW46 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ascl4M0QW46 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ascl4M0QW46 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ascl4M0QW46 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ascl4M0QW46 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ascl4M0QW46 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ascl4M0QW46 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ascl4M0QW46 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ascl4M0QW46 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ascl4M0QW46 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ascl4M0QW46 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ascl4M0QW46 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ascl4M0QW46 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ascl4M0QW46 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ascl4M0QW46 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ascl4M0QW46 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ascl4M0QW46 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ascl4M0QW46 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ascl4M0QW46 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ascl4M0QW46 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ascl4M0QW46 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ascl4M0QW46 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ascl4M0QW46 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ascl4M0QW46 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ascl4M0QW46 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ascl4M0QW46 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ascl4M0QW46 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ascl4M0QW46 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ascl4M0QW46 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ascl4M0QW46 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ascl4M0QW46 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ascl4M0QW46 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ascl4M0QW46 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ascl4M0QW46 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ascl4M0QW46 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ascl4M0QW46 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ascl4M0QW46 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ascl4M0QW46 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ascl4M0QW46 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ascl4M0QW46 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ascl4M0QW46 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ascl4M0QW46 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ascl4M0QW46 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ascl4M0QW46 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ascl4M0QW46 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ascl4M0QW46 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ascl4M0QW46 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ascl4M0QW46 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ascl4M0QW46 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ascl4M0QW46 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ascl4M0QW46 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ascl4M0QW46 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ascl4M0QW46 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ascl4M0QW46 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ascl4M0QW46 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ascl4M0QW46 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ascl4M0QW46 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ascl4M0QW46 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ascl4M0QW46 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ascl4M0QW46 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ascl4M0QW46 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ascl4M0QW46 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ascl4M0QW46 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ascl4M0QW46 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ascl4M0QW46 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ascl4M0QW46 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ascl4M0QW46 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ascl4M0QW46 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ascl4M0QW46 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ascl4M0QW46 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ascl4M0QW46 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ascl4M0QW46 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ascl4M0QW46 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ascl4M0QW46 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ascl4M0QW46 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ascl4M0QW46 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ascl4M0QW46 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ascl4M0QW46 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ascl4M0QW46 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ascl4M0QW46 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ascl4M0QW46 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ascl4M0QW46 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ascl4M0QW46 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ascl4M0QW46 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ascl4M0QW46 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ascl4M0QW46 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ascl4M0QW46 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ascl4M0QW46 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ascl4M0QW46 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms