Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5849J3QPE5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5849J3QPE5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5849J3QPE5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5849J3QPE5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5849J3QPE5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5849J3QPE5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5849J3QPE5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5849J3QPE5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5849J3QPE5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5849J3QPE5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5849J3QPE5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm5849J3QPE5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm5849J3QPE5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm5849J3QPE5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm5849J3QPE5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm5849J3QPE5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm5849J3QPE5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm5849J3QPE5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm5849J3QPE5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm5849J3QPE5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm5849J3QPE5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm5849J3QPE5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm5849J3QPE5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm5849J3QPE5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm5849J3QPE5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm5849J3QPE5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm5849J3QPE5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm5849J3QPE5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm5849J3QPE5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm5849J3QPE5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm5849J3QPE5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm5849J3QPE5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm5849J3QPE5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm5849J3QPE5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm5849J3QPE5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm5849J3QPE5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm5849J3QPE5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm5849J3QPE5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm5849J3QPE5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm5849J3QPE5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm5849J3QPE5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm5849J3QPE5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5849J3QPE5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5849J3QPE5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5849J3QPE5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5849J3QPE5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5849J3QPE5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5849J3QPE5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5849J3QPE5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5849J3QPE5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5849J3QPE5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5849J3QPE5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5849J3QPE5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5849J3QPE5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5849J3QPE5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5849J3QPE5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5849J3QPE5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5849J3QPE5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5849J3QPE5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5849J3QPE5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5849J3QPE5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5849J3QPE5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5849J3QPE5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5849J3QPE5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5849J3QPE5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5849J3QPE5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5849J3QPE5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5849J3QPE5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5849J3QPE5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5849J3QPE5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5849J3QPE5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5849J3QPE5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5849J3QPE5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5849J3QPE5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5849J3QPE5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5849J3QPE5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5849J3QPE5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5849J3QPE5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5849J3QPE5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5849J3QPE5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5849J3QPE5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5849J3QPE5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5849J3QPE5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5849J3QPE5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5849J3QPE5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5849J3QPE5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5849J3QPE5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5849J3QPE5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5849J3QPE5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5849J3QPE5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5849J3QPE5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5849J3QPE5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5849J3QPE5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5849J3QPE5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5849J3QPE5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5849J3QPE5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5849J3QPE5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5849J3QPE5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5849J3QPE5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms