Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5294J3QP53 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5294J3QP53 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5294J3QP53 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5294J3QP53 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5294J3QP53 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5294J3QP53 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5294J3QP53 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5294J3QP53 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5294J3QP53 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5294J3QP53 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5294J3QP53 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5294J3QP53 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5294J3QP53 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5294J3QP53 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5294J3QP53 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5294J3QP53 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5294J3QP53 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5294J3QP53 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm5294J3QP53 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5294J3QP53 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5294J3QP53 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5294J3QP53 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5294J3QP53 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5294J3QP53 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5294J3QP53 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5294J3QP53 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5294J3QP53 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5294J3QP53 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5294J3QP53 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5294J3QP53 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5294J3QP53 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5294J3QP53 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm5294J3QP53 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5294J3QP53 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5294J3QP53 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5294J3QP53 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5294J3QP53 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5294J3QP53 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5294J3QP53 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5294J3QP53 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5294J3QP53 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5294J3QP53 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5294J3QP53 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5294J3QP53 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5294J3QP53 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm5294J3QP53 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5294J3QP53 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5294J3QP53 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5294J3QP53 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5294J3QP53 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm5294J3QP53 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5294J3QP53 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5294J3QP53 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5294J3QP53 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5294J3QP53 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5294J3QP53 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5294J3QP53 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm5294J3QP53 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5294J3QP53 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5294J3QP53 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5294J3QP53 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5294J3QP53 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5294J3QP53 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5294J3QP53 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5294J3QP53 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5294J3QP53 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5294J3QP53 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5294J3QP53 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5294J3QP53 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5294J3QP53 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5294J3QP53 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5294J3QP53 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5294J3QP53 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5294J3QP53 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5294J3QP53 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5294J3QP53 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5294J3QP53 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm5294J3QP53 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5294J3QP53 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5294J3QP53 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5294J3QP53 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5294J3QP53 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5294J3QP53 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5294J3QP53 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5294J3QP53 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5294J3QP53 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm5294J3QP53 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5294J3QP53 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5294J3QP53 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5294J3QP53 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5294J3QP53 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5294J3QP53 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5294J3QP53 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5294J3QP53 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5294J3QP53 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5294J3QP53 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5294J3QP53 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5294J3QP53 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5294J3QP53 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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