Protein–RNA interactions for Protein: J3QP07

B020004C17Rik, RIKEN cDNA B020004C17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B020004C17RikJ3QP07 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
B020004C17RikJ3QP07 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
B020004C17RikJ3QP07 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
B020004C17RikJ3QP07 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
B020004C17RikJ3QP07 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
B020004C17RikJ3QP07 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
B020004C17RikJ3QP07 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
B020004C17RikJ3QP07 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
B020004C17RikJ3QP07 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
B020004C17RikJ3QP07 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
B020004C17RikJ3QP07 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
B020004C17RikJ3QP07 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
B020004C17RikJ3QP07 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
B020004C17RikJ3QP07 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
B020004C17RikJ3QP07 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
B020004C17RikJ3QP07 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
B020004C17RikJ3QP07 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
B020004C17RikJ3QP07 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
B020004C17RikJ3QP07 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
B020004C17RikJ3QP07 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
B020004C17RikJ3QP07 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
B020004C17RikJ3QP07 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
B020004C17RikJ3QP07 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
B020004C17RikJ3QP07 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
B020004C17RikJ3QP07 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
B020004C17RikJ3QP07 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
B020004C17RikJ3QP07 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
B020004C17RikJ3QP07 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
B020004C17RikJ3QP07 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
B020004C17RikJ3QP07 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
B020004C17RikJ3QP07 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
B020004C17RikJ3QP07 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
B020004C17RikJ3QP07 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
B020004C17RikJ3QP07 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
B020004C17RikJ3QP07 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
B020004C17RikJ3QP07 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
B020004C17RikJ3QP07 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
B020004C17RikJ3QP07 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
B020004C17RikJ3QP07 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
B020004C17RikJ3QP07 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
B020004C17RikJ3QP07 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
B020004C17RikJ3QP07 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
B020004C17RikJ3QP07 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
B020004C17RikJ3QP07 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
B020004C17RikJ3QP07 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
B020004C17RikJ3QP07 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
B020004C17RikJ3QP07 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
B020004C17RikJ3QP07 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
B020004C17RikJ3QP07 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
B020004C17RikJ3QP07 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
B020004C17RikJ3QP07 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
B020004C17RikJ3QP07 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
B020004C17RikJ3QP07 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
B020004C17RikJ3QP07 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
B020004C17RikJ3QP07 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
B020004C17RikJ3QP07 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
B020004C17RikJ3QP07 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
B020004C17RikJ3QP07 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
B020004C17RikJ3QP07 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
B020004C17RikJ3QP07 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
B020004C17RikJ3QP07 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
B020004C17RikJ3QP07 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
B020004C17RikJ3QP07 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
B020004C17RikJ3QP07 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
B020004C17RikJ3QP07 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
B020004C17RikJ3QP07 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
B020004C17RikJ3QP07 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
B020004C17RikJ3QP07 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
B020004C17RikJ3QP07 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
B020004C17RikJ3QP07 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
B020004C17RikJ3QP07 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
B020004C17RikJ3QP07 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
B020004C17RikJ3QP07 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
B020004C17RikJ3QP07 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
B020004C17RikJ3QP07 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
B020004C17RikJ3QP07 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
B020004C17RikJ3QP07 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
B020004C17RikJ3QP07 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
B020004C17RikJ3QP07 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
B020004C17RikJ3QP07 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
B020004C17RikJ3QP07 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
B020004C17RikJ3QP07 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
B020004C17RikJ3QP07 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
B020004C17RikJ3QP07 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
B020004C17RikJ3QP07 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
B020004C17RikJ3QP07 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
B020004C17RikJ3QP07 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
B020004C17RikJ3QP07 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
B020004C17RikJ3QP07 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
B020004C17RikJ3QP07 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
B020004C17RikJ3QP07 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
B020004C17RikJ3QP07 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
B020004C17RikJ3QP07 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
B020004C17RikJ3QP07 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
B020004C17RikJ3QP07 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
B020004C17RikJ3QP07 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
B020004C17RikJ3QP07 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
B020004C17RikJ3QP07 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
B020004C17RikJ3QP07 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
B020004C17RikJ3QP07 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms