Protein–RNA interactions for Protein: J3QNY8

Gm19965, Predicted gene, 19965, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm19965J3QNY8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm19965J3QNY8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm19965J3QNY8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm19965J3QNY8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm19965J3QNY8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm19965J3QNY8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm19965J3QNY8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm19965J3QNY8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm19965J3QNY8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm19965J3QNY8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm19965J3QNY8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm19965J3QNY8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm19965J3QNY8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm19965J3QNY8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm19965J3QNY8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm19965J3QNY8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm19965J3QNY8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm19965J3QNY8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm19965J3QNY8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm19965J3QNY8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm19965J3QNY8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm19965J3QNY8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm19965J3QNY8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm19965J3QNY8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm19965J3QNY8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm19965J3QNY8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm19965J3QNY8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm19965J3QNY8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm19965J3QNY8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm19965J3QNY8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm19965J3QNY8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm19965J3QNY8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm19965J3QNY8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm19965J3QNY8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm19965J3QNY8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm19965J3QNY8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm19965J3QNY8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm19965J3QNY8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm19965J3QNY8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm19965J3QNY8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm19965J3QNY8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm19965J3QNY8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm19965J3QNY8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm19965J3QNY8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm19965J3QNY8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm19965J3QNY8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm19965J3QNY8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm19965J3QNY8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm19965J3QNY8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm19965J3QNY8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm19965J3QNY8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm19965J3QNY8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm19965J3QNY8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm19965J3QNY8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm19965J3QNY8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm19965J3QNY8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm19965J3QNY8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm19965J3QNY8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Gm19965J3QNY8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm19965J3QNY8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm19965J3QNY8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm19965J3QNY8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm19965J3QNY8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm19965J3QNY8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm19965J3QNY8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm19965J3QNY8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm19965J3QNY8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm19965J3QNY8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm19965J3QNY8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm19965J3QNY8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm19965J3QNY8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm19965J3QNY8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm19965J3QNY8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm19965J3QNY8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm19965J3QNY8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm19965J3QNY8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm19965J3QNY8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm19965J3QNY8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm19965J3QNY8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm19965J3QNY8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm19965J3QNY8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm19965J3QNY8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm19965J3QNY8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm19965J3QNY8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm19965J3QNY8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm19965J3QNY8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm19965J3QNY8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm19965J3QNY8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm19965J3QNY8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm19965J3QNY8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm19965J3QNY8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm19965J3QNY8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm19965J3QNY8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm19965J3QNY8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm19965J3QNY8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm19965J3QNY8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm19965J3QNY8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm19965J3QNY8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm19965J3QNY8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm19965J3QNY8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms