Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Ccdc180J3QNE4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Ccdc180J3QNE4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Ccdc180J3QNE4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Ccdc180J3QNE4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Ccdc180J3QNE4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Ccdc180J3QNE4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Ccdc180J3QNE4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Ccdc180J3QNE4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Ccdc180J3QNE4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Ccdc180J3QNE4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC37.08■■■■□ 3.53
Ccdc180J3QNE4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
Ccdc180J3QNE4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Ccdc180J3QNE4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.08■■■■□ 3.53
Ccdc180J3QNE4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.53
Ccdc180J3QNE4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
Ccdc180J3QNE4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Ccdc180J3QNE4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Ccdc180J3QNE4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Ccdc180J3QNE4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
Ccdc180J3QNE4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC37.06■■■■□ 3.52
Ccdc180J3QNE4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC37.06■■■■□ 3.52
Ccdc180J3QNE4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Ccdc180J3QNE4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Ccdc180J3QNE4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Ccdc180J3QNE4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Ccdc180J3QNE4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
Ccdc180J3QNE4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Ccdc180J3QNE4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Ccdc180J3QNE4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Ccdc180J3QNE4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Ccdc180J3QNE4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
Ccdc180J3QNE4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Ccdc180J3QNE4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Ccdc180J3QNE4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Ccdc180J3QNE4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Ccdc180J3QNE4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Ccdc180J3QNE4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Ccdc180J3QNE4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Ccdc180J3QNE4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Ccdc180J3QNE4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Ccdc180J3QNE4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Ccdc180J3QNE4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Ccdc180J3QNE4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Ccdc180J3QNE4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Ccdc180J3QNE4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Ccdc180J3QNE4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Ccdc180J3QNE4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Ccdc180J3QNE4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Ccdc180J3QNE4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Ccdc180J3QNE4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Ccdc180J3QNE4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Ccdc180J3QNE4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Ccdc180J3QNE4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Ccdc180J3QNE4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Ccdc180J3QNE4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Ccdc180J3QNE4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Ccdc180J3QNE4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Ccdc180J3QNE4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Ccdc180J3QNE4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Ccdc180J3QNE4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Ccdc180J3QNE4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Ccdc180J3QNE4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Ccdc180J3QNE4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC36.97■■■■□ 3.51
Ccdc180J3QNE4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Ccdc180J3QNE4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Ccdc180J3QNE4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Ccdc180J3QNE4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Ccdc180J3QNE4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Ccdc180J3QNE4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Ccdc180J3QNE4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Ccdc180J3QNE4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Ccdc180J3QNE4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Ccdc180J3QNE4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Ccdc180J3QNE4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
Ccdc180J3QNE4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC36.95■■■■□ 3.51
Ccdc180J3QNE4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Ccdc180J3QNE4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Ccdc180J3QNE4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.5
Ccdc180J3QNE4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Ccdc180J3QNE4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Ccdc180J3QNE4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Ccdc180J3QNE4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Ccdc180J3QNE4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Ccdc180J3QNE4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Ccdc180J3QNE4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
Ccdc180J3QNE4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Ccdc180J3QNE4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Ccdc180J3QNE4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
Ccdc180J3QNE4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Ccdc180J3QNE4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Ccdc180J3QNE4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
Ccdc180J3QNE4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Ccdc180J3QNE4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Ccdc180J3QNE4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Ccdc180J3QNE4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Ccdc180J3QNE4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Ccdc180J3QNE4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Ccdc180J3QNE4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Ccdc180J3QNE4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms