Protein–RNA interactions for Protein: H7BX78

Zfp408, Zinc finger protein 408, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp408H7BX78 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zfp408H7BX78 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zfp408H7BX78 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zfp408H7BX78 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zfp408H7BX78 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zfp408H7BX78 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zfp408H7BX78 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zfp408H7BX78 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zfp408H7BX78 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zfp408H7BX78 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zfp408H7BX78 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zfp408H7BX78 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zfp408H7BX78 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zfp408H7BX78 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zfp408H7BX78 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zfp408H7BX78 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zfp408H7BX78 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zfp408H7BX78 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zfp408H7BX78 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zfp408H7BX78 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Zfp408H7BX78 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Zfp408H7BX78 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Zfp408H7BX78 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Zfp408H7BX78 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Zfp408H7BX78 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Zfp408H7BX78 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zfp408H7BX78 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zfp408H7BX78 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zfp408H7BX78 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zfp408H7BX78 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zfp408H7BX78 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zfp408H7BX78 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zfp408H7BX78 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zfp408H7BX78 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zfp408H7BX78 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zfp408H7BX78 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zfp408H7BX78 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zfp408H7BX78 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zfp408H7BX78 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zfp408H7BX78 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zfp408H7BX78 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zfp408H7BX78 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zfp408H7BX78 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zfp408H7BX78 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zfp408H7BX78 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zfp408H7BX78 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Zfp408H7BX78 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zfp408H7BX78 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zfp408H7BX78 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zfp408H7BX78 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zfp408H7BX78 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zfp408H7BX78 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zfp408H7BX78 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zfp408H7BX78 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zfp408H7BX78 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zfp408H7BX78 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zfp408H7BX78 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zfp408H7BX78 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zfp408H7BX78 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zfp408H7BX78 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zfp408H7BX78 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zfp408H7BX78 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zfp408H7BX78 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zfp408H7BX78 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zfp408H7BX78 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zfp408H7BX78 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zfp408H7BX78 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zfp408H7BX78 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zfp408H7BX78 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zfp408H7BX78 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zfp408H7BX78 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zfp408H7BX78 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zfp408H7BX78 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zfp408H7BX78 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zfp408H7BX78 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zfp408H7BX78 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zfp408H7BX78 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Zfp408H7BX78 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Zfp408H7BX78 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zfp408H7BX78 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zfp408H7BX78 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zfp408H7BX78 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zfp408H7BX78 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zfp408H7BX78 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zfp408H7BX78 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zfp408H7BX78 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zfp408H7BX78 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zfp408H7BX78 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zfp408H7BX78 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zfp408H7BX78 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zfp408H7BX78 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zfp408H7BX78 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zfp408H7BX78 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfp408H7BX78 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfp408H7BX78 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfp408H7BX78 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfp408H7BX78 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfp408H7BX78 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfp408H7BX78 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfp408H7BX78 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms