Protein–RNA interactions for Protein: G5E8V9

Arfip1, ADP-ribosylation factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip1G5E8V9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Arfip1G5E8V9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Arfip1G5E8V9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Arfip1G5E8V9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Arfip1G5E8V9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Arfip1G5E8V9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Arfip1G5E8V9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Arfip1G5E8V9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Arfip1G5E8V9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Arfip1G5E8V9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Arfip1G5E8V9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Arfip1G5E8V9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Arfip1G5E8V9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arfip1G5E8V9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arfip1G5E8V9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arfip1G5E8V9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arfip1G5E8V9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arfip1G5E8V9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arfip1G5E8V9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arfip1G5E8V9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arfip1G5E8V9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arfip1G5E8V9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arfip1G5E8V9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arfip1G5E8V9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arfip1G5E8V9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arfip1G5E8V9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arfip1G5E8V9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arfip1G5E8V9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arfip1G5E8V9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arfip1G5E8V9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arfip1G5E8V9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arfip1G5E8V9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arfip1G5E8V9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arfip1G5E8V9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arfip1G5E8V9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arfip1G5E8V9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arfip1G5E8V9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arfip1G5E8V9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arfip1G5E8V9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arfip1G5E8V9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arfip1G5E8V9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arfip1G5E8V9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arfip1G5E8V9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arfip1G5E8V9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arfip1G5E8V9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arfip1G5E8V9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arfip1G5E8V9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arfip1G5E8V9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arfip1G5E8V9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arfip1G5E8V9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arfip1G5E8V9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arfip1G5E8V9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Arfip1G5E8V9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arfip1G5E8V9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arfip1G5E8V9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arfip1G5E8V9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Arfip1G5E8V9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arfip1G5E8V9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arfip1G5E8V9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arfip1G5E8V9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arfip1G5E8V9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Arfip1G5E8V9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arfip1G5E8V9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arfip1G5E8V9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arfip1G5E8V9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arfip1G5E8V9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arfip1G5E8V9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arfip1G5E8V9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Arfip1G5E8V9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Arfip1G5E8V9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Arfip1G5E8V9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Arfip1G5E8V9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Arfip1G5E8V9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Arfip1G5E8V9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Arfip1G5E8V9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Arfip1G5E8V9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arfip1G5E8V9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arfip1G5E8V9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arfip1G5E8V9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arfip1G5E8V9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Arfip1G5E8V9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Arfip1G5E8V9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arfip1G5E8V9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arfip1G5E8V9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arfip1G5E8V9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arfip1G5E8V9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arfip1G5E8V9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arfip1G5E8V9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arfip1G5E8V9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arfip1G5E8V9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arfip1G5E8V9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arfip1G5E8V9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arfip1G5E8V9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arfip1G5E8V9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arfip1G5E8V9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arfip1G5E8V9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arfip1G5E8V9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arfip1G5E8V9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arfip1G5E8V9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arfip1G5E8V9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms