Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Tubgcp6G5E8P0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tubgcp6G5E8P0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tubgcp6G5E8P0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tubgcp6G5E8P0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tubgcp6G5E8P0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Tubgcp6G5E8P0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tubgcp6G5E8P0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tubgcp6G5E8P0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tubgcp6G5E8P0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tubgcp6G5E8P0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Tubgcp6G5E8P0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tubgcp6G5E8P0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tubgcp6G5E8P0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tubgcp6G5E8P0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tubgcp6G5E8P0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tubgcp6G5E8P0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tubgcp6G5E8P0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tubgcp6G5E8P0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tubgcp6G5E8P0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tubgcp6G5E8P0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tubgcp6G5E8P0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tubgcp6G5E8P0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tubgcp6G5E8P0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tubgcp6G5E8P0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tubgcp6G5E8P0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tubgcp6G5E8P0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tubgcp6G5E8P0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tubgcp6G5E8P0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tubgcp6G5E8P0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tubgcp6G5E8P0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tubgcp6G5E8P0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tubgcp6G5E8P0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tubgcp6G5E8P0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tubgcp6G5E8P0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tubgcp6G5E8P0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tubgcp6G5E8P0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tubgcp6G5E8P0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tubgcp6G5E8P0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tubgcp6G5E8P0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Tubgcp6G5E8P0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tubgcp6G5E8P0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tubgcp6G5E8P0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tubgcp6G5E8P0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tubgcp6G5E8P0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tubgcp6G5E8P0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tubgcp6G5E8P0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tubgcp6G5E8P0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tubgcp6G5E8P0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tubgcp6G5E8P0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Tubgcp6G5E8P0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tubgcp6G5E8P0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tubgcp6G5E8P0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tubgcp6G5E8P0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tubgcp6G5E8P0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tubgcp6G5E8P0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tubgcp6G5E8P0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tubgcp6G5E8P0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tubgcp6G5E8P0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tubgcp6G5E8P0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tubgcp6G5E8P0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Tubgcp6G5E8P0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tubgcp6G5E8P0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tubgcp6G5E8P0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tubgcp6G5E8P0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Tubgcp6G5E8P0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Tubgcp6G5E8P0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Tubgcp6G5E8P0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Tubgcp6G5E8P0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tubgcp6G5E8P0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tubgcp6G5E8P0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tubgcp6G5E8P0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tubgcp6G5E8P0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tubgcp6G5E8P0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tubgcp6G5E8P0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tubgcp6G5E8P0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Tubgcp6G5E8P0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tubgcp6G5E8P0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tubgcp6G5E8P0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tubgcp6G5E8P0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tubgcp6G5E8P0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tubgcp6G5E8P0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tubgcp6G5E8P0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tubgcp6G5E8P0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tubgcp6G5E8P0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tubgcp6G5E8P0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tubgcp6G5E8P0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tubgcp6G5E8P0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tubgcp6G5E8P0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Tubgcp6G5E8P0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tubgcp6G5E8P0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tubgcp6G5E8P0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tubgcp6G5E8P0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tubgcp6G5E8P0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tubgcp6G5E8P0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tubgcp6G5E8P0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tubgcp6G5E8P0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tubgcp6G5E8P0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tubgcp6G5E8P0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tubgcp6G5E8P0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms