Protein–RNA interactions for Protein: G5E861

Sclt1, Sodium channel and clathrin linker 1, mousemouse

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Length 688 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sclt1G5E861 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sclt1G5E861 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sclt1G5E861 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sclt1G5E861 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sclt1G5E861 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Sclt1G5E861 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sclt1G5E861 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sclt1G5E861 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sclt1G5E861 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sclt1G5E861 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sclt1G5E861 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sclt1G5E861 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sclt1G5E861 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sclt1G5E861 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sclt1G5E861 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Sclt1G5E861 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Sclt1G5E861 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sclt1G5E861 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sclt1G5E861 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sclt1G5E861 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sclt1G5E861 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sclt1G5E861 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sclt1G5E861 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sclt1G5E861 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sclt1G5E861 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sclt1G5E861 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sclt1G5E861 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sclt1G5E861 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sclt1G5E861 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sclt1G5E861 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sclt1G5E861 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sclt1G5E861 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sclt1G5E861 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sclt1G5E861 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sclt1G5E861 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sclt1G5E861 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sclt1G5E861 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sclt1G5E861 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sclt1G5E861 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sclt1G5E861 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sclt1G5E861 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sclt1G5E861 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sclt1G5E861 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sclt1G5E861 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sclt1G5E861 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sclt1G5E861 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sclt1G5E861 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sclt1G5E861 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sclt1G5E861 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sclt1G5E861 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sclt1G5E861 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sclt1G5E861 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sclt1G5E861 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sclt1G5E861 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sclt1G5E861 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sclt1G5E861 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sclt1G5E861 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sclt1G5E861 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sclt1G5E861 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sclt1G5E861 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sclt1G5E861 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sclt1G5E861 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sclt1G5E861 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sclt1G5E861 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sclt1G5E861 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sclt1G5E861 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sclt1G5E861 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sclt1G5E861 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Sclt1G5E861 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sclt1G5E861 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sclt1G5E861 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sclt1G5E861 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sclt1G5E861 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sclt1G5E861 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sclt1G5E861 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sclt1G5E861 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sclt1G5E861 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sclt1G5E861 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sclt1G5E861 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sclt1G5E861 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sclt1G5E861 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sclt1G5E861 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sclt1G5E861 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sclt1G5E861 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sclt1G5E861 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sclt1G5E861 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sclt1G5E861 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sclt1G5E861 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sclt1G5E861 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sclt1G5E861 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Sclt1G5E861 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sclt1G5E861 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sclt1G5E861 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sclt1G5E861 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sclt1G5E861 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sclt1G5E861 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sclt1G5E861 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sclt1G5E861 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sclt1G5E861 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sclt1G5E861 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms