Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Pcf11G3X9Z4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Pcf11G3X9Z4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Pcf11G3X9Z4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Pcf11G3X9Z4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Pcf11G3X9Z4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Pcf11G3X9Z4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Pcf11G3X9Z4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
Pcf11G3X9Z4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
Pcf11G3X9Z4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Pcf11G3X9Z4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Pcf11G3X9Z4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Pcf11G3X9Z4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Pcf11G3X9Z4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
Pcf11G3X9Z4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Pcf11G3X9Z4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Pcf11G3X9Z4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Pcf11G3X9Z4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Pcf11G3X9Z4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Pcf11G3X9Z4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Pcf11G3X9Z4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Pcf11G3X9Z4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Pcf11G3X9Z4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Pcf11G3X9Z4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Pcf11G3X9Z4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Pcf11G3X9Z4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Pcf11G3X9Z4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Pcf11G3X9Z4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Pcf11G3X9Z4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Pcf11G3X9Z4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Pcf11G3X9Z4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Pcf11G3X9Z4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Pcf11G3X9Z4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Pcf11G3X9Z4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Pcf11G3X9Z4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Pcf11G3X9Z4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Pcf11G3X9Z4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Pcf11G3X9Z4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Pcf11G3X9Z4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Pcf11G3X9Z4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Pcf11G3X9Z4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Pcf11G3X9Z4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Pcf11G3X9Z4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
Pcf11G3X9Z4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
Pcf11G3X9Z4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Pcf11G3X9Z4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
Pcf11G3X9Z4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Pcf11G3X9Z4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Pcf11G3X9Z4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Pcf11G3X9Z4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Pcf11G3X9Z4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Pcf11G3X9Z4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Pcf11G3X9Z4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Pcf11G3X9Z4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Pcf11G3X9Z4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.53
Pcf11G3X9Z4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Pcf11G3X9Z4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Pcf11G3X9Z4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Pcf11G3X9Z4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Pcf11G3X9Z4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Pcf11G3X9Z4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Pcf11G3X9Z4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Pcf11G3X9Z4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Pcf11G3X9Z4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Pcf11G3X9Z4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Pcf11G3X9Z4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Pcf11G3X9Z4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Pcf11G3X9Z4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Pcf11G3X9Z4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Pcf11G3X9Z4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Pcf11G3X9Z4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Pcf11G3X9Z4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Pcf11G3X9Z4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Pcf11G3X9Z4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Pcf11G3X9Z4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Pcf11G3X9Z4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Pcf11G3X9Z4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Pcf11G3X9Z4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Pcf11G3X9Z4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Pcf11G3X9Z4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
Pcf11G3X9Z4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Pcf11G3X9Z4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Pcf11G3X9Z4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Pcf11G3X9Z4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Pcf11G3X9Z4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Pcf11G3X9Z4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Pcf11G3X9Z4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Pcf11G3X9Z4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Pcf11G3X9Z4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Pcf11G3X9Z4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Pcf11G3X9Z4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Pcf11G3X9Z4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Pcf11G3X9Z4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Pcf11G3X9Z4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Pcf11G3X9Z4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Pcf11G3X9Z4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Pcf11G3X9Z4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Pcf11G3X9Z4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Pcf11G3X9Z4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Pcf11G3X9Z4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms