Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U1

Obox6, Oocyte specific homeobox 6, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox6G3X9U1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Obox6G3X9U1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Obox6G3X9U1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Obox6G3X9U1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Obox6G3X9U1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Obox6G3X9U1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Obox6G3X9U1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Obox6G3X9U1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Obox6G3X9U1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Obox6G3X9U1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Obox6G3X9U1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Obox6G3X9U1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Obox6G3X9U1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Obox6G3X9U1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Obox6G3X9U1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Obox6G3X9U1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Obox6G3X9U1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Obox6G3X9U1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Obox6G3X9U1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Obox6G3X9U1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Obox6G3X9U1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Obox6G3X9U1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Obox6G3X9U1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Obox6G3X9U1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Obox6G3X9U1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Obox6G3X9U1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Obox6G3X9U1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Obox6G3X9U1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Obox6G3X9U1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Obox6G3X9U1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Obox6G3X9U1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Obox6G3X9U1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Obox6G3X9U1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Obox6G3X9U1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Obox6G3X9U1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Obox6G3X9U1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Obox6G3X9U1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Obox6G3X9U1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Obox6G3X9U1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Obox6G3X9U1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Obox6G3X9U1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Obox6G3X9U1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Obox6G3X9U1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Obox6G3X9U1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Obox6G3X9U1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Obox6G3X9U1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Obox6G3X9U1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Obox6G3X9U1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Obox6G3X9U1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Obox6G3X9U1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Obox6G3X9U1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Obox6G3X9U1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Obox6G3X9U1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Obox6G3X9U1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Obox6G3X9U1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Obox6G3X9U1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Obox6G3X9U1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Obox6G3X9U1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Obox6G3X9U1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Obox6G3X9U1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Obox6G3X9U1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Obox6G3X9U1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Obox6G3X9U1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Obox6G3X9U1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Obox6G3X9U1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Obox6G3X9U1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Obox6G3X9U1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Obox6G3X9U1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Obox6G3X9U1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Obox6G3X9U1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Obox6G3X9U1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Obox6G3X9U1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Obox6G3X9U1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Obox6G3X9U1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Obox6G3X9U1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Obox6G3X9U1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Obox6G3X9U1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Obox6G3X9U1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Obox6G3X9U1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Obox6G3X9U1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Obox6G3X9U1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Obox6G3X9U1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Obox6G3X9U1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Obox6G3X9U1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Obox6G3X9U1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Obox6G3X9U1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Obox6G3X9U1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Obox6G3X9U1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Obox6G3X9U1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Obox6G3X9U1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Obox6G3X9U1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Obox6G3X9U1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Obox6G3X9U1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Obox6G3X9U1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Obox6G3X9U1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Obox6G3X9U1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Obox6G3X9U1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Obox6G3X9U1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Obox6G3X9U1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Obox6G3X9U1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms