Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Arfgef1G3X9K3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Arfgef1G3X9K3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Arfgef1G3X9K3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Arfgef1G3X9K3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Arfgef1G3X9K3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Arfgef1G3X9K3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Arfgef1G3X9K3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Arfgef1G3X9K3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Arfgef1G3X9K3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Arfgef1G3X9K3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Arfgef1G3X9K3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Arfgef1G3X9K3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Arfgef1G3X9K3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Arfgef1G3X9K3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Arfgef1G3X9K3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Arfgef1G3X9K3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Arfgef1G3X9K3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Arfgef1G3X9K3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Arfgef1G3X9K3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Arfgef1G3X9K3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Arfgef1G3X9K3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Arfgef1G3X9K3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Arfgef1G3X9K3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Arfgef1G3X9K3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Arfgef1G3X9K3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Arfgef1G3X9K3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Arfgef1G3X9K3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Arfgef1G3X9K3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Arfgef1G3X9K3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Arfgef1G3X9K3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Arfgef1G3X9K3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Arfgef1G3X9K3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Arfgef1G3X9K3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Arfgef1G3X9K3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Arfgef1G3X9K3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Arfgef1G3X9K3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Arfgef1G3X9K3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Arfgef1G3X9K3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Arfgef1G3X9K3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Arfgef1G3X9K3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Arfgef1G3X9K3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Arfgef1G3X9K3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Arfgef1G3X9K3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Arfgef1G3X9K3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Arfgef1G3X9K3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Arfgef1G3X9K3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Arfgef1G3X9K3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Arfgef1G3X9K3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Arfgef1G3X9K3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Arfgef1G3X9K3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Arfgef1G3X9K3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Arfgef1G3X9K3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Arfgef1G3X9K3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Arfgef1G3X9K3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Arfgef1G3X9K3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Arfgef1G3X9K3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Arfgef1G3X9K3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Arfgef1G3X9K3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Arfgef1G3X9K3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Arfgef1G3X9K3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Arfgef1G3X9K3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Arfgef1G3X9K3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Arfgef1G3X9K3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Arfgef1G3X9K3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Arfgef1G3X9K3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Arfgef1G3X9K3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Arfgef1G3X9K3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Arfgef1G3X9K3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Arfgef1G3X9K3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Arfgef1G3X9K3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Arfgef1G3X9K3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Arfgef1G3X9K3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Arfgef1G3X9K3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Arfgef1G3X9K3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Arfgef1G3X9K3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Arfgef1G3X9K3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Arfgef1G3X9K3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Arfgef1G3X9K3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Arfgef1G3X9K3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Arfgef1G3X9K3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Arfgef1G3X9K3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Arfgef1G3X9K3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Arfgef1G3X9K3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Arfgef1G3X9K3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Arfgef1G3X9K3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Arfgef1G3X9K3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Arfgef1G3X9K3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Arfgef1G3X9K3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Arfgef1G3X9K3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Arfgef1G3X9K3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Arfgef1G3X9K3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Arfgef1G3X9K3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Arfgef1G3X9K3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Arfgef1G3X9K3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Arfgef1G3X9K3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Arfgef1G3X9K3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Arfgef1G3X9K3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Arfgef1G3X9K3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Arfgef1G3X9K3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms