Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Z7

Chrna9, Cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 9, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna9G3X8Z7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chrna9G3X8Z7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chrna9G3X8Z7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chrna9G3X8Z7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chrna9G3X8Z7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chrna9G3X8Z7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chrna9G3X8Z7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chrna9G3X8Z7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chrna9G3X8Z7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Chrna9G3X8Z7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chrna9G3X8Z7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chrna9G3X8Z7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chrna9G3X8Z7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chrna9G3X8Z7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Chrna9G3X8Z7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chrna9G3X8Z7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chrna9G3X8Z7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chrna9G3X8Z7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chrna9G3X8Z7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chrna9G3X8Z7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chrna9G3X8Z7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chrna9G3X8Z7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Chrna9G3X8Z7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Chrna9G3X8Z7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Chrna9G3X8Z7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Chrna9G3X8Z7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chrna9G3X8Z7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chrna9G3X8Z7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Chrna9G3X8Z7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chrna9G3X8Z7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chrna9G3X8Z7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chrna9G3X8Z7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chrna9G3X8Z7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chrna9G3X8Z7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chrna9G3X8Z7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chrna9G3X8Z7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chrna9G3X8Z7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chrna9G3X8Z7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chrna9G3X8Z7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chrna9G3X8Z7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chrna9G3X8Z7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chrna9G3X8Z7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chrna9G3X8Z7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chrna9G3X8Z7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chrna9G3X8Z7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chrna9G3X8Z7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chrna9G3X8Z7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chrna9G3X8Z7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chrna9G3X8Z7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chrna9G3X8Z7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chrna9G3X8Z7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chrna9G3X8Z7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Chrna9G3X8Z7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chrna9G3X8Z7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Chrna9G3X8Z7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chrna9G3X8Z7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chrna9G3X8Z7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Chrna9G3X8Z7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chrna9G3X8Z7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chrna9G3X8Z7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chrna9G3X8Z7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chrna9G3X8Z7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chrna9G3X8Z7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chrna9G3X8Z7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chrna9G3X8Z7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Chrna9G3X8Z7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chrna9G3X8Z7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Chrna9G3X8Z7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chrna9G3X8Z7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chrna9G3X8Z7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chrna9G3X8Z7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chrna9G3X8Z7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chrna9G3X8Z7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chrna9G3X8Z7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chrna9G3X8Z7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chrna9G3X8Z7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Chrna9G3X8Z7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chrna9G3X8Z7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chrna9G3X8Z7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chrna9G3X8Z7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chrna9G3X8Z7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Chrna9G3X8Z7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Chrna9G3X8Z7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Chrna9G3X8Z7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Chrna9G3X8Z7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Chrna9G3X8Z7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Chrna9G3X8Z7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Chrna9G3X8Z7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chrna9G3X8Z7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chrna9G3X8Z7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chrna9G3X8Z7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chrna9G3X8Z7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Chrna9G3X8Z7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chrna9G3X8Z7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chrna9G3X8Z7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chrna9G3X8Z7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chrna9G3X8Z7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chrna9G3X8Z7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chrna9G3X8Z7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chrna9G3X8Z7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms