Protein–RNA interactions for Protein: G3X8R9

Tmigd3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd3G3X8R9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmigd3G3X8R9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmigd3G3X8R9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmigd3G3X8R9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmigd3G3X8R9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmigd3G3X8R9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmigd3G3X8R9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmigd3G3X8R9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmigd3G3X8R9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmigd3G3X8R9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmigd3G3X8R9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmigd3G3X8R9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmigd3G3X8R9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmigd3G3X8R9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmigd3G3X8R9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmigd3G3X8R9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmigd3G3X8R9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmigd3G3X8R9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmigd3G3X8R9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmigd3G3X8R9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmigd3G3X8R9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmigd3G3X8R9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmigd3G3X8R9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmigd3G3X8R9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmigd3G3X8R9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmigd3G3X8R9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmigd3G3X8R9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmigd3G3X8R9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmigd3G3X8R9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmigd3G3X8R9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmigd3G3X8R9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmigd3G3X8R9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmigd3G3X8R9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmigd3G3X8R9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmigd3G3X8R9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmigd3G3X8R9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmigd3G3X8R9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmigd3G3X8R9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmigd3G3X8R9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmigd3G3X8R9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmigd3G3X8R9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmigd3G3X8R9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmigd3G3X8R9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmigd3G3X8R9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmigd3G3X8R9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmigd3G3X8R9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmigd3G3X8R9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmigd3G3X8R9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmigd3G3X8R9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmigd3G3X8R9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmigd3G3X8R9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmigd3G3X8R9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmigd3G3X8R9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmigd3G3X8R9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmigd3G3X8R9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmigd3G3X8R9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmigd3G3X8R9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmigd3G3X8R9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmigd3G3X8R9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmigd3G3X8R9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmigd3G3X8R9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmigd3G3X8R9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmigd3G3X8R9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmigd3G3X8R9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmigd3G3X8R9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmigd3G3X8R9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmigd3G3X8R9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmigd3G3X8R9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmigd3G3X8R9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmigd3G3X8R9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmigd3G3X8R9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmigd3G3X8R9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmigd3G3X8R9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmigd3G3X8R9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmigd3G3X8R9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmigd3G3X8R9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmigd3G3X8R9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmigd3G3X8R9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmigd3G3X8R9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmigd3G3X8R9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmigd3G3X8R9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmigd3G3X8R9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmigd3G3X8R9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmigd3G3X8R9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmigd3G3X8R9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmigd3G3X8R9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmigd3G3X8R9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmigd3G3X8R9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmigd3G3X8R9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmigd3G3X8R9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmigd3G3X8R9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmigd3G3X8R9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmigd3G3X8R9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmigd3G3X8R9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmigd3G3X8R9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmigd3G3X8R9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmigd3G3X8R9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmigd3G3X8R9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmigd3G3X8R9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmigd3G3X8R9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms