Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r167G3UW71 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r167G3UW71 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r167G3UW71 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r167G3UW71 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r167G3UW71 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r167G3UW71 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r167G3UW71 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r167G3UW71 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r167G3UW71 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r167G3UW71 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r167G3UW71 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r167G3UW71 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r167G3UW71 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r167G3UW71 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vmn1r167G3UW71 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r167G3UW71 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r167G3UW71 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r167G3UW71 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r167G3UW71 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r167G3UW71 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r167G3UW71 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r167G3UW71 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r167G3UW71 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r167G3UW71 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r167G3UW71 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r167G3UW71 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r167G3UW71 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r167G3UW71 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r167G3UW71 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r167G3UW71 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r167G3UW71 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r167G3UW71 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r167G3UW71 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r167G3UW71 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r167G3UW71 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r167G3UW71 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r167G3UW71 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r167G3UW71 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r167G3UW71 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r167G3UW71 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r167G3UW71 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r167G3UW71 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r167G3UW71 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r167G3UW71 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r167G3UW71 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r167G3UW71 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r167G3UW71 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r167G3UW71 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r167G3UW71 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r167G3UW71 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r167G3UW71 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r167G3UW71 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r167G3UW71 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r167G3UW71 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r167G3UW71 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r167G3UW71 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r167G3UW71 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r167G3UW71 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r167G3UW71 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r167G3UW71 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r167G3UW71 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r167G3UW71 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r167G3UW71 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r167G3UW71 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r167G3UW71 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r167G3UW71 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r167G3UW71 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r167G3UW71 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r167G3UW71 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r167G3UW71 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r167G3UW71 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r167G3UW71 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r167G3UW71 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r167G3UW71 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r167G3UW71 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r167G3UW71 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r167G3UW71 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r167G3UW71 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r167G3UW71 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r167G3UW71 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r167G3UW71 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r167G3UW71 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r167G3UW71 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r167G3UW71 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r167G3UW71 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r167G3UW71 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r167G3UW71 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r167G3UW71 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r167G3UW71 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r167G3UW71 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r167G3UW71 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r167G3UW71 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r167G3UW71 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r167G3UW71 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r167G3UW71 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r167G3UW71 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r167G3UW71 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r167G3UW71 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r167G3UW71 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms