Protein–RNA interactions for Protein: F6ZR08

Gm15056, Predicted gene 15056, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm15056F6ZR08 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm15056F6ZR08 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm15056F6ZR08 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm15056F6ZR08 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm15056F6ZR08 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm15056F6ZR08 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm15056F6ZR08 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm15056F6ZR08 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm15056F6ZR08 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm15056F6ZR08 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm15056F6ZR08 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm15056F6ZR08 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm15056F6ZR08 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm15056F6ZR08 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm15056F6ZR08 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm15056F6ZR08 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm15056F6ZR08 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm15056F6ZR08 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm15056F6ZR08 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm15056F6ZR08 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm15056F6ZR08 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm15056F6ZR08 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm15056F6ZR08 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm15056F6ZR08 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm15056F6ZR08 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm15056F6ZR08 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm15056F6ZR08 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm15056F6ZR08 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm15056F6ZR08 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm15056F6ZR08 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm15056F6ZR08 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm15056F6ZR08 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm15056F6ZR08 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm15056F6ZR08 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm15056F6ZR08 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm15056F6ZR08 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm15056F6ZR08 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm15056F6ZR08 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm15056F6ZR08 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm15056F6ZR08 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm15056F6ZR08 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm15056F6ZR08 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm15056F6ZR08 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm15056F6ZR08 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms