Protein–RNA interactions for Protein: F6ZGR6

D430041D05Rik, RIKEN cDNA D430041D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D430041D05RikF6ZGR6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
D430041D05RikF6ZGR6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
D430041D05RikF6ZGR6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
D430041D05RikF6ZGR6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
D430041D05RikF6ZGR6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
D430041D05RikF6ZGR6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
D430041D05RikF6ZGR6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
D430041D05RikF6ZGR6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
D430041D05RikF6ZGR6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
D430041D05RikF6ZGR6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
D430041D05RikF6ZGR6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
D430041D05RikF6ZGR6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
D430041D05RikF6ZGR6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
D430041D05RikF6ZGR6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
D430041D05RikF6ZGR6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
D430041D05RikF6ZGR6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
D430041D05RikF6ZGR6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
D430041D05RikF6ZGR6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
D430041D05RikF6ZGR6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
D430041D05RikF6ZGR6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
D430041D05RikF6ZGR6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
D430041D05RikF6ZGR6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
D430041D05RikF6ZGR6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
D430041D05RikF6ZGR6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
D430041D05RikF6ZGR6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
D430041D05RikF6ZGR6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
D430041D05RikF6ZGR6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
D430041D05RikF6ZGR6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
D430041D05RikF6ZGR6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
D430041D05RikF6ZGR6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
D430041D05RikF6ZGR6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
D430041D05RikF6ZGR6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
D430041D05RikF6ZGR6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
D430041D05RikF6ZGR6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
D430041D05RikF6ZGR6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
D430041D05RikF6ZGR6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
D430041D05RikF6ZGR6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
D430041D05RikF6ZGR6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
D430041D05RikF6ZGR6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
D430041D05RikF6ZGR6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
D430041D05RikF6ZGR6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
D430041D05RikF6ZGR6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
D430041D05RikF6ZGR6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
D430041D05RikF6ZGR6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
D430041D05RikF6ZGR6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
D430041D05RikF6ZGR6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
D430041D05RikF6ZGR6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
D430041D05RikF6ZGR6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
D430041D05RikF6ZGR6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
D430041D05RikF6ZGR6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
D430041D05RikF6ZGR6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
D430041D05RikF6ZGR6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
D430041D05RikF6ZGR6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
D430041D05RikF6ZGR6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
D430041D05RikF6ZGR6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
D430041D05RikF6ZGR6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
D430041D05RikF6ZGR6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
D430041D05RikF6ZGR6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
D430041D05RikF6ZGR6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
D430041D05RikF6ZGR6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
D430041D05RikF6ZGR6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
D430041D05RikF6ZGR6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
D430041D05RikF6ZGR6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
D430041D05RikF6ZGR6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
D430041D05RikF6ZGR6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
D430041D05RikF6ZGR6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
D430041D05RikF6ZGR6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
D430041D05RikF6ZGR6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
D430041D05RikF6ZGR6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
D430041D05RikF6ZGR6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
D430041D05RikF6ZGR6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
D430041D05RikF6ZGR6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
D430041D05RikF6ZGR6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
D430041D05RikF6ZGR6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
D430041D05RikF6ZGR6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
D430041D05RikF6ZGR6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
D430041D05RikF6ZGR6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
D430041D05RikF6ZGR6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
D430041D05RikF6ZGR6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
D430041D05RikF6ZGR6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
D430041D05RikF6ZGR6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
D430041D05RikF6ZGR6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
D430041D05RikF6ZGR6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
D430041D05RikF6ZGR6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
D430041D05RikF6ZGR6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
D430041D05RikF6ZGR6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
D430041D05RikF6ZGR6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
D430041D05RikF6ZGR6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
D430041D05RikF6ZGR6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
D430041D05RikF6ZGR6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
D430041D05RikF6ZGR6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
D430041D05RikF6ZGR6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
D430041D05RikF6ZGR6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
D430041D05RikF6ZGR6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
D430041D05RikF6ZGR6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
D430041D05RikF6ZGR6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
D430041D05RikF6ZGR6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
D430041D05RikF6ZGR6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
D430041D05RikF6ZGR6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
D430041D05RikF6ZGR6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms