Protein–RNA interactions for Protein: F6W043

Vmn2r40, Vomeronasal 2, receptor 40, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r40F6W043 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn2r40F6W043 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn2r40F6W043 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn2r40F6W043 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn2r40F6W043 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn2r40F6W043 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn2r40F6W043 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn2r40F6W043 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn2r40F6W043 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn2r40F6W043 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn2r40F6W043 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn2r40F6W043 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn2r40F6W043 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn2r40F6W043 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn2r40F6W043 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn2r40F6W043 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn2r40F6W043 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn2r40F6W043 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn2r40F6W043 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn2r40F6W043 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn2r40F6W043 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn2r40F6W043 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn2r40F6W043 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn2r40F6W043 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn2r40F6W043 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn2r40F6W043 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn2r40F6W043 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn2r40F6W043 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn2r40F6W043 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn2r40F6W043 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn2r40F6W043 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn2r40F6W043 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn2r40F6W043 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn2r40F6W043 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn2r40F6W043 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn2r40F6W043 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn2r40F6W043 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn2r40F6W043 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn2r40F6W043 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn2r40F6W043 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn2r40F6W043 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn2r40F6W043 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn2r40F6W043 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn2r40F6W043 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn2r40F6W043 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn2r40F6W043 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn2r40F6W043 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn2r40F6W043 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn2r40F6W043 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn2r40F6W043 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn2r40F6W043 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn2r40F6W043 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn2r40F6W043 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn2r40F6W043 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn2r40F6W043 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn2r40F6W043 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn2r40F6W043 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn2r40F6W043 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn2r40F6W043 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn2r40F6W043 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn2r40F6W043 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn2r40F6W043 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn2r40F6W043 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn2r40F6W043 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn2r40F6W043 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn2r40F6W043 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn2r40F6W043 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn2r40F6W043 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn2r40F6W043 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn2r40F6W043 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn2r40F6W043 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn2r40F6W043 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn2r40F6W043 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn2r40F6W043 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn2r40F6W043 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn2r40F6W043 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn2r40F6W043 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn2r40F6W043 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn2r40F6W043 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn2r40F6W043 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn2r40F6W043 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn2r40F6W043 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn2r40F6W043 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn2r40F6W043 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn2r40F6W043 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn2r40F6W043 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn2r40F6W043 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn2r40F6W043 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn2r40F6W043 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn2r40F6W043 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn2r40F6W043 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn2r40F6W043 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn2r40F6W043 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn2r40F6W043 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn2r40F6W043 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn2r40F6W043 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn2r40F6W043 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn2r40F6W043 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn2r40F6W043 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn2r40F6W043 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms