Protein–RNA interactions for Protein: F6SG70

Gm28374, Predicted gene 28374 (Fragment), mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28374F6SG70 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm28374F6SG70 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm28374F6SG70 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm28374F6SG70 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm28374F6SG70 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm28374F6SG70 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm28374F6SG70 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm28374F6SG70 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm28374F6SG70 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm28374F6SG70 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm28374F6SG70 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm28374F6SG70 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm28374F6SG70 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28374F6SG70 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28374F6SG70 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28374F6SG70 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28374F6SG70 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28374F6SG70 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28374F6SG70 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28374F6SG70 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28374F6SG70 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28374F6SG70 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28374F6SG70 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28374F6SG70 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28374F6SG70 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28374F6SG70 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28374F6SG70 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm28374F6SG70 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm28374F6SG70 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm28374F6SG70 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm28374F6SG70 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm28374F6SG70 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm28374F6SG70 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm28374F6SG70 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm28374F6SG70 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm28374F6SG70 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm28374F6SG70 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm28374F6SG70 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm28374F6SG70 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm28374F6SG70 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm28374F6SG70 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm28374F6SG70 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm28374F6SG70 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm28374F6SG70 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm28374F6SG70 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm28374F6SG70 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm28374F6SG70 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm28374F6SG70 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28374F6SG70 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28374F6SG70 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28374F6SG70 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28374F6SG70 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28374F6SG70 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28374F6SG70 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28374F6SG70 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28374F6SG70 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28374F6SG70 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28374F6SG70 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28374F6SG70 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28374F6SG70 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28374F6SG70 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm28374F6SG70 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28374F6SG70 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28374F6SG70 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28374F6SG70 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28374F6SG70 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28374F6SG70 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28374F6SG70 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28374F6SG70 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28374F6SG70 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28374F6SG70 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28374F6SG70 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28374F6SG70 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm28374F6SG70 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28374F6SG70 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28374F6SG70 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28374F6SG70 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28374F6SG70 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28374F6SG70 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28374F6SG70 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28374F6SG70 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28374F6SG70 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28374F6SG70 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28374F6SG70 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28374F6SG70 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm28374F6SG70 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm28374F6SG70 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm28374F6SG70 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm28374F6SG70 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm28374F6SG70 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm28374F6SG70 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm28374F6SG70 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm28374F6SG70 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm28374F6SG70 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm28374F6SG70 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm28374F6SG70 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm28374F6SG70 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm28374F6SG70 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm28374F6SG70 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm28374F6SG70 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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