Protein–RNA interactions for Protein: F6R3P9

Prl3d2, Growth hormone d5, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prl3d2F6R3P9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prl3d2F6R3P9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prl3d2F6R3P9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prl3d2F6R3P9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prl3d2F6R3P9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prl3d2F6R3P9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prl3d2F6R3P9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prl3d2F6R3P9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prl3d2F6R3P9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prl3d2F6R3P9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prl3d2F6R3P9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prl3d2F6R3P9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prl3d2F6R3P9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prl3d2F6R3P9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prl3d2F6R3P9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Prl3d2F6R3P9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prl3d2F6R3P9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prl3d2F6R3P9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prl3d2F6R3P9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prl3d2F6R3P9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prl3d2F6R3P9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prl3d2F6R3P9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prl3d2F6R3P9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prl3d2F6R3P9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Prl3d2F6R3P9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prl3d2F6R3P9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prl3d2F6R3P9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prl3d2F6R3P9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prl3d2F6R3P9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prl3d2F6R3P9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prl3d2F6R3P9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Prl3d2F6R3P9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prl3d2F6R3P9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prl3d2F6R3P9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prl3d2F6R3P9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prl3d2F6R3P9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prl3d2F6R3P9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prl3d2F6R3P9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prl3d2F6R3P9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prl3d2F6R3P9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prl3d2F6R3P9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prl3d2F6R3P9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prl3d2F6R3P9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prl3d2F6R3P9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Prl3d2F6R3P9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Prl3d2F6R3P9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Prl3d2F6R3P9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prl3d2F6R3P9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prl3d2F6R3P9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prl3d2F6R3P9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prl3d2F6R3P9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prl3d2F6R3P9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prl3d2F6R3P9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prl3d2F6R3P9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prl3d2F6R3P9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prl3d2F6R3P9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prl3d2F6R3P9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prl3d2F6R3P9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prl3d2F6R3P9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prl3d2F6R3P9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prl3d2F6R3P9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prl3d2F6R3P9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prl3d2F6R3P9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Prl3d2F6R3P9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prl3d2F6R3P9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prl3d2F6R3P9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prl3d2F6R3P9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prl3d2F6R3P9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prl3d2F6R3P9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prl3d2F6R3P9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prl3d2F6R3P9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prl3d2F6R3P9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prl3d2F6R3P9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prl3d2F6R3P9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prl3d2F6R3P9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prl3d2F6R3P9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prl3d2F6R3P9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prl3d2F6R3P9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prl3d2F6R3P9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prl3d2F6R3P9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prl3d2F6R3P9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prl3d2F6R3P9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prl3d2F6R3P9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prl3d2F6R3P9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prl3d2F6R3P9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prl3d2F6R3P9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prl3d2F6R3P9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prl3d2F6R3P9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prl3d2F6R3P9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prl3d2F6R3P9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prl3d2F6R3P9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prl3d2F6R3P9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prl3d2F6R3P9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Prl3d2F6R3P9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Prl3d2F6R3P9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Prl3d2F6R3P9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Prl3d2F6R3P9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Prl3d2F6R3P9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Prl3d2F6R3P9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prl3d2F6R3P9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms