Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Taf4E9QAP7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Taf4E9QAP7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Taf4E9QAP7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Taf4E9QAP7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Taf4E9QAP7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Taf4E9QAP7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Taf4E9QAP7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Taf4E9QAP7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Taf4E9QAP7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Taf4E9QAP7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Taf4E9QAP7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Taf4E9QAP7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Taf4E9QAP7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Taf4E9QAP7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Taf4E9QAP7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Taf4E9QAP7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Taf4E9QAP7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Taf4E9QAP7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Taf4E9QAP7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Taf4E9QAP7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Taf4E9QAP7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Taf4E9QAP7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Taf4E9QAP7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Taf4E9QAP7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Taf4E9QAP7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Taf4E9QAP7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Taf4E9QAP7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Taf4E9QAP7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Taf4E9QAP7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Taf4E9QAP7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Taf4E9QAP7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Taf4E9QAP7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Taf4E9QAP7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Taf4E9QAP7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Taf4E9QAP7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Taf4E9QAP7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Taf4E9QAP7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Taf4E9QAP7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Taf4E9QAP7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Taf4E9QAP7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Taf4E9QAP7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Taf4E9QAP7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Taf4E9QAP7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Taf4E9QAP7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Taf4E9QAP7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Taf4E9QAP7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Taf4E9QAP7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Taf4E9QAP7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Taf4E9QAP7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Taf4E9QAP7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Taf4E9QAP7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Taf4E9QAP7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Taf4E9QAP7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Taf4E9QAP7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Taf4E9QAP7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Taf4E9QAP7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Taf4E9QAP7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Taf4E9QAP7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Taf4E9QAP7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Taf4E9QAP7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Taf4E9QAP7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Taf4E9QAP7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Taf4E9QAP7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Taf4E9QAP7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Taf4E9QAP7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Taf4E9QAP7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Taf4E9QAP7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Taf4E9QAP7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Taf4E9QAP7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Taf4E9QAP7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Taf4E9QAP7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Taf4E9QAP7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Taf4E9QAP7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Taf4E9QAP7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Taf4E9QAP7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Taf4E9QAP7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Taf4E9QAP7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Taf4E9QAP7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Taf4E9QAP7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Taf4E9QAP7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Taf4E9QAP7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Taf4E9QAP7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Taf4E9QAP7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Taf4E9QAP7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Taf4E9QAP7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Taf4E9QAP7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Taf4E9QAP7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Taf4E9QAP7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Taf4E9QAP7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Taf4E9QAP7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Taf4E9QAP7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Taf4E9QAP7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Taf4E9QAP7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Taf4E9QAP7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Taf4E9QAP7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Taf4E9QAP7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Taf4E9QAP7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf4E9QAP7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Taf4E9QAP7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms