Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cald1E9QA15 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Cald1E9QA15 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cald1E9QA15 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cald1E9QA15 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cald1E9QA15 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cald1E9QA15 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Cald1E9QA15 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cald1E9QA15 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cald1E9QA15 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cald1E9QA15 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cald1E9QA15 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cald1E9QA15 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cald1E9QA15 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cald1E9QA15 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cald1E9QA15 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cald1E9QA15 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cald1E9QA15 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cald1E9QA15 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cald1E9QA15 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cald1E9QA15 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cald1E9QA15 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cald1E9QA15 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cald1E9QA15 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cald1E9QA15 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cald1E9QA15 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cald1E9QA15 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cald1E9QA15 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cald1E9QA15 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cald1E9QA15 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Cald1E9QA15 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cald1E9QA15 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cald1E9QA15 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cald1E9QA15 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cald1E9QA15 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cald1E9QA15 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cald1E9QA15 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cald1E9QA15 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cald1E9QA15 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cald1E9QA15 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cald1E9QA15 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Cald1E9QA15 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cald1E9QA15 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cald1E9QA15 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cald1E9QA15 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cald1E9QA15 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cald1E9QA15 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cald1E9QA15 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Cald1E9QA15 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cald1E9QA15 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cald1E9QA15 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cald1E9QA15 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cald1E9QA15 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cald1E9QA15 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cald1E9QA15 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cald1E9QA15 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cald1E9QA15 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cald1E9QA15 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cald1E9QA15 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cald1E9QA15 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cald1E9QA15 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cald1E9QA15 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cald1E9QA15 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cald1E9QA15 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cald1E9QA15 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cald1E9QA15 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cald1E9QA15 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Cald1E9QA15 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cald1E9QA15 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cald1E9QA15 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cald1E9QA15 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cald1E9QA15 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cald1E9QA15 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cald1E9QA15 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Cald1E9QA15 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cald1E9QA15 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cald1E9QA15 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cald1E9QA15 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cald1E9QA15 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Cald1E9QA15 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cald1E9QA15 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cald1E9QA15 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cald1E9QA15 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cald1E9QA15 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cald1E9QA15 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cald1E9QA15 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cald1E9QA15 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cald1E9QA15 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cald1E9QA15 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Cald1E9QA15 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Cald1E9QA15 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cald1E9QA15 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cald1E9QA15 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cald1E9QA15 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cald1E9QA15 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cald1E9QA15 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cald1E9QA15 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cald1E9QA15 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cald1E9QA15 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cald1E9QA15 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms