Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc146E9Q9F7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc146E9Q9F7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc146E9Q9F7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc146E9Q9F7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc146E9Q9F7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc146E9Q9F7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc146E9Q9F7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc146E9Q9F7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc146E9Q9F7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc146E9Q9F7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc146E9Q9F7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc146E9Q9F7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc146E9Q9F7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc146E9Q9F7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc146E9Q9F7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc146E9Q9F7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc146E9Q9F7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc146E9Q9F7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc146E9Q9F7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc146E9Q9F7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc146E9Q9F7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc146E9Q9F7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc146E9Q9F7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc146E9Q9F7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc146E9Q9F7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc146E9Q9F7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc146E9Q9F7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc146E9Q9F7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc146E9Q9F7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc146E9Q9F7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc146E9Q9F7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc146E9Q9F7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc146E9Q9F7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc146E9Q9F7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc146E9Q9F7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc146E9Q9F7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc146E9Q9F7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc146E9Q9F7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc146E9Q9F7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc146E9Q9F7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc146E9Q9F7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc146E9Q9F7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc146E9Q9F7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc146E9Q9F7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc146E9Q9F7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc146E9Q9F7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc146E9Q9F7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc146E9Q9F7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc146E9Q9F7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc146E9Q9F7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc146E9Q9F7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc146E9Q9F7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc146E9Q9F7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc146E9Q9F7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc146E9Q9F7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc146E9Q9F7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc146E9Q9F7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc146E9Q9F7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc146E9Q9F7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc146E9Q9F7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc146E9Q9F7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc146E9Q9F7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc146E9Q9F7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc146E9Q9F7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc146E9Q9F7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc146E9Q9F7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc146E9Q9F7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc146E9Q9F7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc146E9Q9F7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc146E9Q9F7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc146E9Q9F7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc146E9Q9F7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc146E9Q9F7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc146E9Q9F7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc146E9Q9F7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc146E9Q9F7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc146E9Q9F7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc146E9Q9F7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc146E9Q9F7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc146E9Q9F7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc146E9Q9F7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc146E9Q9F7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc146E9Q9F7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc146E9Q9F7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc146E9Q9F7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc146E9Q9F7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc146E9Q9F7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc146E9Q9F7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc146E9Q9F7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc146E9Q9F7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc146E9Q9F7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc146E9Q9F7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc146E9Q9F7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc146E9Q9F7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc146E9Q9F7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc146E9Q9F7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc146E9Q9F7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc146E9Q9F7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc146E9Q9F7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms