Protein–RNA interactions for Protein: E9Q956

Mcmdc2, Minichromosome maintenance domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcmdc2E9Q956 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mcmdc2E9Q956 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mcmdc2E9Q956 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mcmdc2E9Q956 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Mcmdc2E9Q956 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mcmdc2E9Q956 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mcmdc2E9Q956 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mcmdc2E9Q956 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mcmdc2E9Q956 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mcmdc2E9Q956 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mcmdc2E9Q956 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mcmdc2E9Q956 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mcmdc2E9Q956 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mcmdc2E9Q956 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mcmdc2E9Q956 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mcmdc2E9Q956 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mcmdc2E9Q956 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mcmdc2E9Q956 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mcmdc2E9Q956 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mcmdc2E9Q956 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mcmdc2E9Q956 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mcmdc2E9Q956 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mcmdc2E9Q956 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mcmdc2E9Q956 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mcmdc2E9Q956 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mcmdc2E9Q956 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mcmdc2E9Q956 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mcmdc2E9Q956 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mcmdc2E9Q956 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mcmdc2E9Q956 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mcmdc2E9Q956 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mcmdc2E9Q956 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mcmdc2E9Q956 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mcmdc2E9Q956 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mcmdc2E9Q956 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mcmdc2E9Q956 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mcmdc2E9Q956 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mcmdc2E9Q956 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mcmdc2E9Q956 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mcmdc2E9Q956 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mcmdc2E9Q956 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mcmdc2E9Q956 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mcmdc2E9Q956 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Mcmdc2E9Q956 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mcmdc2E9Q956 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mcmdc2E9Q956 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mcmdc2E9Q956 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mcmdc2E9Q956 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mcmdc2E9Q956 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mcmdc2E9Q956 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mcmdc2E9Q956 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mcmdc2E9Q956 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mcmdc2E9Q956 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mcmdc2E9Q956 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mcmdc2E9Q956 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mcmdc2E9Q956 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mcmdc2E9Q956 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mcmdc2E9Q956 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mcmdc2E9Q956 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mcmdc2E9Q956 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mcmdc2E9Q956 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mcmdc2E9Q956 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mcmdc2E9Q956 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mcmdc2E9Q956 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mcmdc2E9Q956 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Mcmdc2E9Q956 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Mcmdc2E9Q956 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Mcmdc2E9Q956 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mcmdc2E9Q956 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mcmdc2E9Q956 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mcmdc2E9Q956 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mcmdc2E9Q956 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mcmdc2E9Q956 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mcmdc2E9Q956 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mcmdc2E9Q956 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mcmdc2E9Q956 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mcmdc2E9Q956 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mcmdc2E9Q956 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mcmdc2E9Q956 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mcmdc2E9Q956 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mcmdc2E9Q956 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mcmdc2E9Q956 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mcmdc2E9Q956 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mcmdc2E9Q956 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mcmdc2E9Q956 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mcmdc2E9Q956 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mcmdc2E9Q956 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mcmdc2E9Q956 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Mcmdc2E9Q956 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mcmdc2E9Q956 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mcmdc2E9Q956 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mcmdc2E9Q956 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Mcmdc2E9Q956 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mcmdc2E9Q956 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mcmdc2E9Q956 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mcmdc2E9Q956 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mcmdc2E9Q956 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mcmdc2E9Q956 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mcmdc2E9Q956 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Mcmdc2E9Q956 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms