Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5Z5

Fancf, Fanconi anemia group F protein, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancfE9Q5Z5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FancfE9Q5Z5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FancfE9Q5Z5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FancfE9Q5Z5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FancfE9Q5Z5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FancfE9Q5Z5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
FancfE9Q5Z5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FancfE9Q5Z5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FancfE9Q5Z5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FancfE9Q5Z5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FancfE9Q5Z5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
FancfE9Q5Z5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FancfE9Q5Z5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FancfE9Q5Z5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FancfE9Q5Z5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FancfE9Q5Z5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FancfE9Q5Z5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FancfE9Q5Z5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FancfE9Q5Z5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FancfE9Q5Z5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FancfE9Q5Z5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FancfE9Q5Z5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FancfE9Q5Z5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FancfE9Q5Z5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FancfE9Q5Z5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FancfE9Q5Z5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
FancfE9Q5Z5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FancfE9Q5Z5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FancfE9Q5Z5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FancfE9Q5Z5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FancfE9Q5Z5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FancfE9Q5Z5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FancfE9Q5Z5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FancfE9Q5Z5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
FancfE9Q5Z5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FancfE9Q5Z5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FancfE9Q5Z5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FancfE9Q5Z5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FancfE9Q5Z5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FancfE9Q5Z5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FancfE9Q5Z5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FancfE9Q5Z5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FancfE9Q5Z5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FancfE9Q5Z5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FancfE9Q5Z5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FancfE9Q5Z5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FancfE9Q5Z5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FancfE9Q5Z5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FancfE9Q5Z5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FancfE9Q5Z5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FancfE9Q5Z5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FancfE9Q5Z5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FancfE9Q5Z5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FancfE9Q5Z5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FancfE9Q5Z5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FancfE9Q5Z5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FancfE9Q5Z5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
FancfE9Q5Z5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
FancfE9Q5Z5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FancfE9Q5Z5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FancfE9Q5Z5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FancfE9Q5Z5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FancfE9Q5Z5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FancfE9Q5Z5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
FancfE9Q5Z5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FancfE9Q5Z5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FancfE9Q5Z5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FancfE9Q5Z5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FancfE9Q5Z5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FancfE9Q5Z5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FancfE9Q5Z5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FancfE9Q5Z5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FancfE9Q5Z5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FancfE9Q5Z5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FancfE9Q5Z5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FancfE9Q5Z5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FancfE9Q5Z5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FancfE9Q5Z5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FancfE9Q5Z5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FancfE9Q5Z5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FancfE9Q5Z5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FancfE9Q5Z5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FancfE9Q5Z5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FancfE9Q5Z5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
FancfE9Q5Z5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
FancfE9Q5Z5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FancfE9Q5Z5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FancfE9Q5Z5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
FancfE9Q5Z5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FancfE9Q5Z5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FancfE9Q5Z5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FancfE9Q5Z5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FancfE9Q5Z5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FancfE9Q5Z5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FancfE9Q5Z5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FancfE9Q5Z5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FancfE9Q5Z5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FancfE9Q5Z5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FancfE9Q5Z5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FancfE9Q5Z5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms