Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L7

Gm20715, Predicted gene 20715, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20715E9Q3L7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20715E9Q3L7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20715E9Q3L7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20715E9Q3L7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20715E9Q3L7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20715E9Q3L7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20715E9Q3L7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20715E9Q3L7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20715E9Q3L7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20715E9Q3L7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20715E9Q3L7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20715E9Q3L7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20715E9Q3L7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20715E9Q3L7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20715E9Q3L7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20715E9Q3L7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20715E9Q3L7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20715E9Q3L7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20715E9Q3L7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20715E9Q3L7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20715E9Q3L7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20715E9Q3L7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20715E9Q3L7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20715E9Q3L7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20715E9Q3L7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20715E9Q3L7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20715E9Q3L7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20715E9Q3L7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20715E9Q3L7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20715E9Q3L7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm20715E9Q3L7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm20715E9Q3L7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm20715E9Q3L7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm20715E9Q3L7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm20715E9Q3L7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20715E9Q3L7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20715E9Q3L7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20715E9Q3L7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20715E9Q3L7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20715E9Q3L7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20715E9Q3L7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20715E9Q3L7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20715E9Q3L7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20715E9Q3L7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20715E9Q3L7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20715E9Q3L7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20715E9Q3L7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20715E9Q3L7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm20715E9Q3L7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20715E9Q3L7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20715E9Q3L7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20715E9Q3L7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20715E9Q3L7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20715E9Q3L7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20715E9Q3L7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20715E9Q3L7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20715E9Q3L7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20715E9Q3L7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20715E9Q3L7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20715E9Q3L7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20715E9Q3L7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20715E9Q3L7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20715E9Q3L7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20715E9Q3L7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20715E9Q3L7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm20715E9Q3L7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20715E9Q3L7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20715E9Q3L7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20715E9Q3L7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20715E9Q3L7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20715E9Q3L7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20715E9Q3L7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20715E9Q3L7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20715E9Q3L7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20715E9Q3L7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20715E9Q3L7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20715E9Q3L7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm20715E9Q3L7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20715E9Q3L7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20715E9Q3L7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20715E9Q3L7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20715E9Q3L7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20715E9Q3L7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20715E9Q3L7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20715E9Q3L7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20715E9Q3L7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20715E9Q3L7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20715E9Q3L7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20715E9Q3L7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm20715E9Q3L7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20715E9Q3L7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20715E9Q3L7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20715E9Q3L7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20715E9Q3L7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20715E9Q3L7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20715E9Q3L7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20715E9Q3L7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20715E9Q3L7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20715E9Q3L7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm20715E9Q3L7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms