Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930579F01RikE9Q3L6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
4930579F01RikE9Q3L6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
4930579F01RikE9Q3L6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930579F01RikE9Q3L6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms