Protein–RNA interactions for Protein: E9PYF4

Lmo7, LIM domain only 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo7E9PYF4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Lmo7E9PYF4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Lmo7E9PYF4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Lmo7E9PYF4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
Lmo7E9PYF4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Lmo7E9PYF4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Lmo7E9PYF4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Lmo7E9PYF4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Lmo7E9PYF4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Lmo7E9PYF4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
Lmo7E9PYF4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Lmo7E9PYF4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Lmo7E9PYF4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Lmo7E9PYF4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Lmo7E9PYF4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Lmo7E9PYF4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Lmo7E9PYF4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Lmo7E9PYF4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Lmo7E9PYF4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Lmo7E9PYF4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Lmo7E9PYF4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Lmo7E9PYF4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Lmo7E9PYF4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Lmo7E9PYF4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Lmo7E9PYF4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Lmo7E9PYF4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Lmo7E9PYF4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Lmo7E9PYF4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Lmo7E9PYF4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Lmo7E9PYF4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Lmo7E9PYF4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Lmo7E9PYF4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Lmo7E9PYF4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Lmo7E9PYF4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Lmo7E9PYF4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Lmo7E9PYF4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Lmo7E9PYF4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Lmo7E9PYF4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Lmo7E9PYF4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Lmo7E9PYF4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Lmo7E9PYF4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Lmo7E9PYF4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Lmo7E9PYF4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Lmo7E9PYF4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Lmo7E9PYF4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Lmo7E9PYF4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Lmo7E9PYF4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Lmo7E9PYF4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Lmo7E9PYF4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Lmo7E9PYF4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Lmo7E9PYF4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Lmo7E9PYF4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Lmo7E9PYF4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Lmo7E9PYF4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Lmo7E9PYF4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Lmo7E9PYF4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Lmo7E9PYF4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Lmo7E9PYF4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Lmo7E9PYF4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Lmo7E9PYF4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Lmo7E9PYF4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Lmo7E9PYF4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Lmo7E9PYF4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Lmo7E9PYF4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Lmo7E9PYF4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Lmo7E9PYF4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Lmo7E9PYF4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Lmo7E9PYF4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Lmo7E9PYF4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Lmo7E9PYF4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Lmo7E9PYF4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Lmo7E9PYF4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Lmo7E9PYF4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Lmo7E9PYF4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Lmo7E9PYF4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Lmo7E9PYF4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Lmo7E9PYF4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Lmo7E9PYF4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Lmo7E9PYF4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Lmo7E9PYF4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Lmo7E9PYF4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Lmo7E9PYF4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Lmo7E9PYF4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Lmo7E9PYF4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Lmo7E9PYF4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Lmo7E9PYF4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Lmo7E9PYF4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Lmo7E9PYF4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Lmo7E9PYF4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Lmo7E9PYF4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Lmo7E9PYF4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Lmo7E9PYF4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Lmo7E9PYF4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Lmo7E9PYF4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Lmo7E9PYF4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Lmo7E9PYF4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Lmo7E9PYF4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Lmo7E9PYF4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Lmo7E9PYF4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Lmo7E9PYF4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms