Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Srp54bE9PXC0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Srp54bE9PXC0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Srp54bE9PXC0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Srp54bE9PXC0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Srp54bE9PXC0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Srp54bE9PXC0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Srp54bE9PXC0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Srp54bE9PXC0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Srp54bE9PXC0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Srp54bE9PXC0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Srp54bE9PXC0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Srp54bE9PXC0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Srp54bE9PXC0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Srp54bE9PXC0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Srp54bE9PXC0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Srp54bE9PXC0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Srp54bE9PXC0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Srp54bE9PXC0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Srp54bE9PXC0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Srp54bE9PXC0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Srp54bE9PXC0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Srp54bE9PXC0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Srp54bE9PXC0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Srp54bE9PXC0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Srp54bE9PXC0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Srp54bE9PXC0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Srp54bE9PXC0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Srp54bE9PXC0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Srp54bE9PXC0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Srp54bE9PXC0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Srp54bE9PXC0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Srp54bE9PXC0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Srp54bE9PXC0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Srp54bE9PXC0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Srp54bE9PXC0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Srp54bE9PXC0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Srp54bE9PXC0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Srp54bE9PXC0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Srp54bE9PXC0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Srp54bE9PXC0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Srp54bE9PXC0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Srp54bE9PXC0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Srp54bE9PXC0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Srp54bE9PXC0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Srp54bE9PXC0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Srp54bE9PXC0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Srp54bE9PXC0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Srp54bE9PXC0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Srp54bE9PXC0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Srp54bE9PXC0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Srp54bE9PXC0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Srp54bE9PXC0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Srp54bE9PXC0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Srp54bE9PXC0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Srp54bE9PXC0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Srp54bE9PXC0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Srp54bE9PXC0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Srp54bE9PXC0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Srp54bE9PXC0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Srp54bE9PXC0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Srp54bE9PXC0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Srp54bE9PXC0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Srp54bE9PXC0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Srp54bE9PXC0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Srp54bE9PXC0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Srp54bE9PXC0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Srp54bE9PXC0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Srp54bE9PXC0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Srp54bE9PXC0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Srp54bE9PXC0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Srp54bE9PXC0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Srp54bE9PXC0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Srp54bE9PXC0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Srp54bE9PXC0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Srp54bE9PXC0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Srp54bE9PXC0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Srp54bE9PXC0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Srp54bE9PXC0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Srp54bE9PXC0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Srp54bE9PXC0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Srp54bE9PXC0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Srp54bE9PXC0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Srp54bE9PXC0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Srp54bE9PXC0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Srp54bE9PXC0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Srp54bE9PXC0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Srp54bE9PXC0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Srp54bE9PXC0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Srp54bE9PXC0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Srp54bE9PXC0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Srp54bE9PXC0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Srp54bE9PXC0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Srp54bE9PXC0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Srp54bE9PXC0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Srp54bE9PXC0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Srp54bE9PXC0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Srp54bE9PXC0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Srp54bE9PXC0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Srp54bE9PXC0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms