Protein–RNA interactions for Protein: E9PWL0

Trim30d, Tripartite motif-containing 30D, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30dE9PWL0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim30dE9PWL0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim30dE9PWL0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim30dE9PWL0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim30dE9PWL0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Trim30dE9PWL0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Trim30dE9PWL0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim30dE9PWL0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim30dE9PWL0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim30dE9PWL0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim30dE9PWL0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim30dE9PWL0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim30dE9PWL0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim30dE9PWL0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim30dE9PWL0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim30dE9PWL0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim30dE9PWL0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim30dE9PWL0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim30dE9PWL0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim30dE9PWL0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim30dE9PWL0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim30dE9PWL0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim30dE9PWL0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim30dE9PWL0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim30dE9PWL0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim30dE9PWL0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim30dE9PWL0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim30dE9PWL0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim30dE9PWL0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim30dE9PWL0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim30dE9PWL0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim30dE9PWL0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim30dE9PWL0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim30dE9PWL0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim30dE9PWL0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim30dE9PWL0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim30dE9PWL0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim30dE9PWL0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim30dE9PWL0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim30dE9PWL0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim30dE9PWL0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim30dE9PWL0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim30dE9PWL0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim30dE9PWL0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim30dE9PWL0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim30dE9PWL0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim30dE9PWL0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim30dE9PWL0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim30dE9PWL0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim30dE9PWL0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim30dE9PWL0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim30dE9PWL0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim30dE9PWL0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim30dE9PWL0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim30dE9PWL0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim30dE9PWL0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim30dE9PWL0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim30dE9PWL0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim30dE9PWL0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim30dE9PWL0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim30dE9PWL0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim30dE9PWL0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim30dE9PWL0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim30dE9PWL0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim30dE9PWL0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim30dE9PWL0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim30dE9PWL0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim30dE9PWL0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim30dE9PWL0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim30dE9PWL0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim30dE9PWL0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim30dE9PWL0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim30dE9PWL0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim30dE9PWL0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim30dE9PWL0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim30dE9PWL0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim30dE9PWL0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim30dE9PWL0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim30dE9PWL0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim30dE9PWL0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim30dE9PWL0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim30dE9PWL0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim30dE9PWL0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim30dE9PWL0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim30dE9PWL0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim30dE9PWL0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim30dE9PWL0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim30dE9PWL0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim30dE9PWL0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim30dE9PWL0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim30dE9PWL0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trim30dE9PWL0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trim30dE9PWL0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim30dE9PWL0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim30dE9PWL0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim30dE9PWL0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim30dE9PWL0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim30dE9PWL0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim30dE9PWL0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim30dE9PWL0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms